Detta protokoll syftar till att kvantifiera SARS-CoV-2-RNA i avloppsvatten- och luftprover som ska användas för avloppsvattenbaserade epidemiologiska studier och för att bedöma exponeringsrisken för SARS-CoV-2 i aerosoler inomhus och utomhus. Detta protokoll beskriver också en sekvenseringsmetod med lång mall för SARS-CoV-2 helgenomkarakterisering.