Vi beskriver en immunofluorescens og kvantitativ PCR-metode for lokalisering og kvantifisering av begomovirus i insektvev. Immunofluorescensprotokollen kan brukes til å samlokalisere virale og vektorproteiner. Den kvantitative PCR-protokollen kan utvides til å kvantifisere virus i hele whitefly-legemer og virusinfiserte planter.