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In vitro Auswahl von modifizierten Transkriptionsrepressoren für gezieltes epigenetisches Silencing
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Chapitres
- 00:05Introduction
- 01:34Engineering a Fluorescence-Based Reporter Cell Line
- 03:10Designing gRNAs for CRISPR/dCas9-Based Epigenetic Silencing of Target Gene
- 04:13Arrayed Transient Delivery of CRISPR/dCas9-Based ETRs in Reporter Cell Line
- 07:19Analyzing Transcriptional Activity of Target Gene Over Time
- 08:11Results: dCas9 ETR-Mediated Epigenetic Silencing of Human B2M Gene by gRNAs
- 09:23Conclusion
In dieser Arbeit stellen wir ein Protokoll für die in vitro Selektion von technisch hergestellten Transkriptionsrepressoren (ETRs) mit hoher, langfristiger, stabiler On-Target-Silencing-Effizienz und geringer genomweiter Off-Target-Aktivität vor. Dieser Arbeitsablauf ermöglicht es, ein anfängliches, komplexes Repertoire von ETR-Kandidaten auf eine kurze Liste zu reduzieren, die für die weitere Evaluierung in therapeutisch relevanten Umgebungen geeignet ist.
