वर्तमान प्रोटोकॉल प्रकाश शीट फ्लोरोसेंट माइक्रोस्कोपी और स्वचालित सॉफ्टवेयर सहायता प्राप्त तरीकों का वर्णन करता है ताकि बरकरार, साफ अंगों और ऊतकों में प्रसार और निष्क्रिय ट्रिपैनोसोमा क्रूज़ी परजीवी और टी कोशिकाओं की कल्पना और सटीक मात्रा निर्धारित की जा सके। ये तकनीकें उपचार के परिणामों का मूल्यांकन करने और परजीवी-मेजबान इंटरैक्शन में नई अंतर्दृष्टि प्रदान करने का एक विश्वसनीय तरीका प्रदान करती हैं।