Journal
/
Biochimie
/
Een geïntegreerde workflow van identificatie en kwantificering op FDR Control-Based Untargeted Metabolome
Journal JoVE
Biochimie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biochimie
An Integrated Workflow of Identification and Quantification on FDR Control-Based Untargeted Metabolome
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Een geïntegreerde workflow van identificatie en kwantificering op FDR Control-Based Untargeted Metabolome

DOI:
10.3791/63625-v

•

05:35 min

•

September 20, 2022

•

, , ,
1Key Laboratory of Functional Protein Research of Guangdong Higher Education Institutes and MOE Key Laboratory of Tumor Molecular Biology, Institute of Life and Health Engineering, College of Life Science and Technology,Jinan University, 2Chi-Biotech Co. Ltd.

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 01:07Preparing Metabolomics Datasets
  • 02:21Metabolite Identification and Differential Analysis
  • 03:49Results: Quantitative Analysis by MetaX
  • 04:52Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

We bouwden een ongerichte metabolomische workflow die XY-Meta en metaX samen integreerde. In dit protocol hebben we laten zien hoe we XY-Meta kunnen gebruiken om een lokspectrale bibliotheek te genereren uit open access spectrareferentie, en vervolgens FDR-controle uitgevoerd en de metaX gebruikt om de metabolieten te kwantificeren na het identificeren van de metabolomics-spectra.

Tags

FDR ControlUntargeted MetabolomeXY-MetaTarget-decoy StrategyMetabolite IdentificationFalse Positive ReductionBiomarker DiscoveryGNPS DatabaseProteoWizardRaw Data ConversionNIST LibraryXY-Meta ProgramMetaX SoftwareQuantitative AnalysisPCA PlotPeak Annotation

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

Een eenvoudige methode voor High Throughput chemische Screening in Caenorhabditis Elegans

Identificatie van cycline-afhankelijk Kinase 1 specifieke fosforylatie Sites door een Kinase In Vitro Assay

Kwantificering van hypopigmentatie activiteit In Vitro

Kwantificering van co-enzym A in cellen en weefsels

Een geïntegreerde Raman-spectroscopie en massaspectrometrie platform voor het bestuderen van de opname van één cel drug, metabolisme, en effecten

Ongerichte vloeibare chromatografie-massaspectrometrie-gebaseerde metabolomics analyse van tarwekorrel

Workflow en tools voor kristallografische fragmentscreening in het Helmholtz-Zentrum Berlin

Evaluatie van het effect van pesticiden op de larven van de solitaire bijen

Kwantificering van subcellulaire glycogeenverdeling in skeletspiervezels met behulp van transmissie-elektronenmicroscopie

Deciphering Molecular Mechanism of Histone Assembly by DNA Curtain Technique

Read Article