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核密度分析的天然染色质沉淀测序文库的生成

Journal JoVE
Génétique

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Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

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核密度分析的天然染色质沉淀测序文库的生成

DOI:

10.3791/56085-v

•

10:05 min

•

December 12, 2017

•

Alireza Lorzadeh, Rodrigo Lopez Gutierrez, Linda Jackson, Michelle Moksa, Martin Hirst²

¹Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology,University of British Columbia, ²Canada’s Michael Smith Genome Science Center,BC Cancer Agency

Chapitres

00:05Titre
00:51Cell Lysis and Chromatin Digestion for Nucleosome Density ChIP-se
03:21Immunprecipitation Reaction for Nucleosome Density ChIP-seq
04:33Washes and Elution for Nucleosome Density ChIP-seq
07:31Results: Evaluation of Nucleosome Density ChIP-seq Libraries
08:50Conclusion

Summary

Traduction automatique

我们提出了一个改良的本地染色质沉淀测序 (芯片-seq) 的方法, 以生成序列数据集适合核密度芯片-seq 分析框架集成 micrococcal 核酸 (MNase) 可及性组蛋白修饰测量。

Tags

Keywords: Native Chromatin Immunoprecipitation Nucleosome Density Analysis Epigenetics Epigenomic Features Chromatin Signatures MNase Cell Preparation Lysis Buffer MNase Digestion EDTA

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