Journal
/
Biochimie
/
LERLIC-MS / MS for Indgående Karakterisering og Kvantificering af glutamin og asparagin deamidering i Shotgun Proteomics
Journal JoVE
Biochimie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biochimie
LERLIC-MS/MS for In-depth Characterization and Quantification of Glutamine and Asparagine Deamidation in Shotgun Proteomics

LERLIC-MS / MS for Indgående Karakterisering og Kvantificering af glutamin og asparagin deamidering i Shotgun Proteomics

DOI:
10.3791/55626-v

•

08:01 min

•

April 09, 2017

•

, ,
1Division of Structural Biology and Biochemistry, School of Biological Sciences,Nanyang Technological University

Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:44Long-length Anion-exchange (LAX) Capillary Column Packing
  • 01:43Tissue Sample Preparation
  • 05:33One-dimension Long-length Electrostatic Repulsion-hydrophilic Interaction Chromatography-tandem Mass Spectrometry (LERLIC-MS/MS) Separation and Data Analysis
  • 06:48Results: Separation of Deamidation Isoforms of Glutamine and Asparagine by LERLIC-MS/MS
  • 07:34Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Her præsenterer vi en trin-for-trin-protokollen af ​​den lange længde elektrostatisk frastødning-hydrofil interaktionskromatografi-tandem massespektrometri (LERLIC-MS / MS) metode. Dette er en hidtil ukendt metode, som gør det muligt for første gang kvantificering og karakterisering af glutamin og asparagin deamideringssteder isoformer med shotgun proteomics.

Tags

Keywords: LERLIC-MS/MSGlutamine DeamidationAsparagine DeamidationShotgun ProteomicsPeptide SeparationAnion Exchange ChromatographyProtein QuantificationDithiothreitolIodoacetamide

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/55626?article_type=v

Dyb proteomet profilering af Isobar mærkning, omfattende væskekromatografi, massespektrometri og Software-assisteret kvantificering
check_url/fr/55626?article_type=v

Karakterisering af glykoproteiner med immunglobulin Fold af røntgenkrystallografi og biofysiske metoder
check_url/fr/55626?article_type=v

Ekstracellulære Protein Microarray teknologi til High Throughput påvisning af lav affinitet Receptor-Ligand interaktioner
check_url/fr/55626?article_type=v

Påvisning af proteinubiquitinationssteder ved peptidberigelse og massespektrometri
check_url/fr/55626?article_type=v

SUMO-bindende enheder (SUBEs) som værktøjer til berigelse, isolation, identifikation og karakterisering af SUMO Proteome i leverkræft
check_url/fr/55626?article_type=v

TMT Prøve forberedelse til Proteomics Facility Indsendelse og efterfølgende dataanalyse
check_url/fr/55626?article_type=v

En massespektrometribaseret proteomics-tilgang til global R-methyleringsanalyse med høj konfidensprotein
check_url/fr/55626?article_type=v

JUMPn: En strømlinet applikation til protein co-ekspressionsklynger og netværksanalyse i proteomics
check_url/fr/55626?article_type=v

Shotgun Proteomics prøvebehandling automatiseret af en open source lab robot
check_url/fr/55626?article_type=v

Shotgun lipidomics af gnavervæv

Read Article