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L'extraction d'acide nucléique et efficace de l'ARNr 16S bactérien pour Séquençage génique communautaire Caractérisation
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
Efficient Nucleic Acid Extraction and 16S rRNA Gene Sequencing for Bacterial Community Characterization

L'extraction d'acide nucléique et efficace de l'ARNr 16S bactérien pour Séquençage génique communautaire Caractérisation

DOI:

12:37 min

April 14, 2016

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Chapitres

  • 00:05Titre
  • 00:57Extraction of Total Nucleic Acid from Cervicovaginal Swabs (Phenol-Chloroform Extraction)
  • 05:52PCR Amplification of the 16S rRNA Gene V4 Hypervariable Region
  • 09:40Library Pooling and High-Throughput Sequencing
  • 10:30Evaluation of Nucleic Acid Extraction and 16S rRNA Gene PCR Amplification
  • 11:35Conclusion

Summary

Traduction automatique

Nous décrivons une méthode efficace, robuste et rentable pour extraire l'acide nucléique à partir des prélèvements pour la caractérisation des communautés bactériennes en utilisant ARNr 16S séquençage de l'amplicon du gène. La méthode permet une approche de traitement commun pour les types d'échantillons multiples et peut accueillir un certain nombre de processus d'analyse en aval.

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