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Primer Extension Capture: Gezielte Sequence Retrieval von stark degradierte DNA Sources
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September 03, 2009
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Wir präsentieren eine Methode zur gezielten alten DNA-Sequenz Abruf, die wir benutzt, um die komplette mitochondriale Genom von fünf Neandertal Individuen zu rekonstruieren. Der Vergleich dieser Sequenzen mit den heutigen Menschen nahe, dass Neandertaler eine langfristige geringe effektive Populationsgröße hatte.
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Targeted DNA Sequence RetrievalHeavily Degraded DNA SourcesMicrobial DNA ContaminationAncient BonesSample Destruction ReductionSequencing Demands ReductionDirect PCRShotgun SequencingComplete Mitochondrial DNA (mtDNA) GenomesNeandertalsGeographic RangeMtDNA Genetic DiversityLate NeandertalsContemporary Modern HumansEffective Population Size
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Briggs, A. W., Good, J. M., Green, R. E., Krause, J., Maricic, T., Stenzel, U., Pääbo, S. Primer Extension Capture: Targeted Sequence Retrieval from Heavily Degraded DNA Sources. J. Vis. Exp. (31), e1573, doi:10.3791/1573 (2009).
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