Summary

Purification et caractérisation biophysique de la myosine-7a humaine basée sur le système MultiBac

Published: August 23, 2024
doi:

Summary

Ce protocole détaille les procédures de production recombinante de l’holoenzyme myosine-7a humaine à l’aide du système de baculovirus MultiBac et d’étude de sa motilité à l’aide d’un test de glissement de filament in vitro sur mesure.

Abstract

La myosine-7a est une protéine motrice basée sur l’actine essentielle aux processus auditifs et visuels. Les mutations de la myosine-7a conduisent au syndrome d’Usher de type 1, la forme la plus courante et la plus grave de surdicécité chez l’homme. On suppose que la myosine-7a forme un complexe d’adhésion transmembranaire avec d’autres protéines Usher, essentiel à l’intégrité structurelle et fonctionnelle des cellules photoréceptrices et des cellules ciliées cochléaires. Cependant, en raison des défis liés à l’obtention de protéines pures et intactes, les mécanismes fonctionnels exacts de la myosine-7a humaine restent insaisissables, avec peu d’études structurelles et biomécaniques disponibles. Des études récentes ont montré que la myosine-7a de mammifère est un complexe moteur multimérique composé d’une chaîne lourde et de trois types de chaînes légères : la chaîne légère régulatrice (RLC), la calmoduline et la protéine 4 de type calmoduline (CALML4). Contrairement à la calmoduline, CALML4 ne se lie pas aux ions calcium. Les calmodulines, sensibles au calcium et insensibles, sont essentielles à la myosine-7a de mammifère pour un bon réglage fin de ses propriétés mécaniques. Ici, nous décrivons une méthode détaillée pour produire une holoenzyme humaine recombinante de myosine-7a à l’aide du système d’expression de la protéine MultiBac Baculovirus. Cela permet d’obtenir des quantités de milligrammes de protéines complètes de haute pureté, ce qui permet leur caractérisation biochimique et biophysique. Nous présentons en outre un protocole pour évaluer ses propriétés mécaniques et mobiles à l’aide de tests de motilité in vitro sur mesure et de microscopie à fluorescence. La disponibilité de la protéine myosine-7a humaine intacte, ainsi que le protocole de caractérisation fonctionnelle détaillé décrit ici, ouvrent la voie à d’autres investigations sur les aspects moléculaires de la myosine-7a dans la vision et l’audition.

Introduction

Les myosines sont des protéines motrices moléculaires qui interagissent avec l’actine pour piloter de nombreux processus cellulaires 1,2,3,4. L’homme possède 12 classes et 39 gènes de la myosine5, qui sont impliqués dans un large éventail de fonctions physiologiques, telles que la contraction musculaire6 et les processus sensoriels7. Chaque molécule de myosine est un complexe multimérique composé d’une chaîne lourde et de chaînes légères. La chaîne lourde est divisée en régions de la tête, du cou et de la queue. La tête contient des sites de liaison à l’actine et aux nucléotides qui sont responsables de l’hydrolyse de l’ATP et de la génération de la force sur les filaments d’actine2. Le col est formé de plusieurs motifs IQ α-hélicoïdaux où un ensemble spécifique de chaînes lumineuses sont liés. Ensemble, ils fonctionnent comme un bras de levier pour amplifier les changements conformationnels du moteur en grands mouvements 8,9,10. La queue contient des sous-domaines spécifiques à une classe et joue un rôle régulateur dans l’ajustement de l’activité motrice de la myosine et la médiation des interactions avec les partenaires de liaison cellulaire 2,11.

La myosine humaine 7a, membre des myosines de classe 7, est essentielle aux processus auditifs et visuels12,13. Les motifs IQ de la myosine-7a humaine sont associés à une combinaison unique de chaînes légères, y compris la chaîne légère régulatrice (RLC), la calmoduline et la protéine 4 de type calmoduline (CALML4)14,15,16. En plus de stabiliser le bras de levier, ces chaînes légères régulent les propriétés mécaniques de la myosine-7a en réponse à la signalisation calcique, une caractéristique qui semble être unique à l’isoforme14 des mammifères.

Des défauts dans le gène codant pour la chaîne lourde de la myosine-7a (MYO7A/USH1B) sont responsables du syndrome d’Usher de type 1, la forme la plus grave de perte combinée de la vision et de l’ouïe chez l’homme17. De plus, le gène de la chaîne légère CALML4 fait partie des gènes candidats cartographiés pour contenir l’allèle causal de l’USH1H, une autre variante du syndrome d’Usher de type 115,18. Dans la rétine, la myosine-7a est exprimée dans l’épithélium pigmentaire rétinien et les cellules photoréceptrices13. Il a été impliqué dans la localisation des mélanosomes dans l’épithélium pigmentaire rétinien (EPR)19 et la phagocytose des disques du segment externe des photorécepteurs par les cellules EPR20. Dans l’oreille interne, la myosine-7a se trouve principalement dans les stéréocils, où elle joue un rôle essentiel dans l’établissement des faisceaux de cheveux et dans le déclenchement du processus de transduction mécano-électrique 12,21,22.

Si l’importance de la myosine-7a dans les cellules sensorielles est bien établie, ses mécanismes fonctionnels au niveau moléculaire restent mal compris. Cette lacune dans les connaissances est en partie due aux défis liés à la purification de la protéine intacte, en particulier de l’isoforme de mammifère. Récemment, des progrès significatifs ont été réalisés en utilisant le système MultiBac pour exprimer de manière recombinante l’holoenzyme14 complète de la myosine humaine 7a. Cette avancée a permis des caractérisations structurales et biophysiques de cette protéine motrice, conduisant à la découverte de plusieurs propriétés uniques de la myosine-7a humaine qui sont spécifiquement adaptées aux fonctions auditives des mammifères14,23.

Le système MultiBac est une plate-forme avancée de cellules de baculovirus/insectes spécialement conçue pour l’expression de complexes multimériques eucaryotes24,25. Une caractéristique clé de ce système est sa capacité à héberger plusieurs cassettes d’expression génique, chacune codant pour une sous-unité du complexe, au sein d’un seul baculovirus MultiBac. L’assemblage des cassettes d’expression multigénique est facilité par un module dit de multiplication : un site d’endonucléase à tête chercheuse (HE) et un site BstXI conçu par correspondance flanquant les sites de clonage multiple (MCS). Ce module permet l’assemblage itératif d’une cassette d’expression unique par restriction/ligature, en tirant parti du fait que les sites de restriction HE et BstXI sont éliminés lors de leur ligature. Dans cet article, la chaîne lourde de la myosine-7a humaine, la RLC, la calmoduline et le CALML4 sont chacun clonés dans le module de multiplication du vecteur pACEBac1 (Figure 1A), qui sont ensuite assemblés en une cassette d’expression multigénique par le processus itératif (Figure 1B). La cassette multigénique de la myosine-7a est intégrée dans le génome du baculovirus (bacmid) par la transposition de l’élément mini-Tn7 du vecteur pACEBac1 vers le site cible de la mini-attTn7 dans le génome (Figure 1C). Suivant les procédures de purification du bacmid, de production et d’amplification du baculovirus (figures 1D, E), le baculovirus recombinant myosine-7a MultiBac est préparé et peut être utilisé pour la production de protéines à grande échelle (figure 1F). De plus, les chaînes légères de myosine-7a peuvent être produites séparément chez E. coli et purifiées à l’aide d’une étiquette His6-SUMO clivable 26,27,28. Les chaînes légères purifiées sont utiles pour étudier leur dynamique de liaison et la régulation de la myosine-7a.

La protéine myosine-7a purifiée peut être soumise à des études structurales, biochimiques et biophysiques pour mieux comprendre la régulation structurelle-fonctionnelle de cette protéine motrice. De plus, ses interactions avec le réseau d’actine et d’autres protéines de liaison29 peuvent être examinées à l’aide de diverses approches de reconstitution in vitro. Les résultats de ces analyses éclaireront les propriétés biophysiques de cette myosine, conduisant à une compréhension mécaniste de la façon dont la myosine-7a entraîne les changements cytosquelettiques et, en fin de compte, façonne la morphologie et la fonction uniques des cellules sensorielles. Dans cet article, nous détaillons un flux de travail pour le test de glissement des filaments d’actine qui a été spécifiquement adapté à la myosine-7a de mammifère. Le test de glissement des filaments d’actine est un test de motilité in vitro robuste qui étudie quantitativement le mouvement des filaments d’actine fluorescents propulsés par un grand nombre de moteurs de myosine immobilisés sur une surface de lamelle 30,31,32. Les avantages de ce test comprennent sa simplicité d’installation, ses exigences minimales en matière d’équipement (un microscope à fluorescence à grand champ équipé d’un appareil photo numérique) et sa grande reproductibilité. De plus, comme le mouvement des filaments d’actine est entraîné par un groupe de moteurs de myosine immobilisés, ce test est particulièrement utile pour étudier la motilité des myosines monomères telles que la myosine-7a14,33. Les protocoles comprennent plusieurs modifications, allant des procédures expérimentales à l’analyse d’imagerie, spécifiquement adaptées aux propriétés mobiles uniques de la myosine-7a de mammifère. Grâce à la disponibilité de la protéine myosine-7a intacte et au protocole de caractérisation fonctionnelle décrit ici, cet article jette les bases d’une étude plus approfondie des rôles moléculaires de la myosine-7a dans les processus physiologiques et pathologiques.

Protocol

REMARQUE : Nous décrivons ici un protocole permettant de synthétiser l’holoenzyme humaine intacte myosine-7a et de caractériser sa motilité in vitro. Ce protocole est divisé en trois sections : premièrement, l’expression de la myosine-7a humaine à l’aide du système d’expression de la protéine du baculovirus MultiBac ; Deuxièmement, la purification des chaînes légères de myosine-7a séparément à l’aide du système E.coli His6-SUMO ; et enfin, l’étude de la motilité de la myosine-7A h…

Representative Results

Le complexe myosine-7a purifié et les protéines à chaînes légères peuvent être évalués par électrophorèse sur gel SDS-PAGE, comme le montre la figure 3. La bande au-dessus du marqueur de 200 kDa correspond à la chaîne lourde de la myosine-7a (255 kDa). Les trois bandes qui migrent entre les marqueurs de 22 et 14 kDa de haut en bas sont respectivement RLC (20 kDa), calmoduline et CALML4. Alors que la calmoduline et CALML4 ont un poids moléculaire similaire d’environ 17 kDa, le…

Discussion

Voici un protocole détaillé pour la production de la protéine myosine-7a humaine recombinante à partir de cellules d’insectes. Bien que le système Sf9/baculovirus ait été utilisé pour produire une variété de myosines 40,41,42,43, ce n’est que récemment que la myosine-7a de mammifère a été purifiée avec succès à l’aide du système de baculovirus MultiBac

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Nous remercions le centre d’imagerie microscopique et le centre de fonction visuelle et de morphologie de l’Université de Virginie-Occidentale pour la discussion et l’aide à l’analyse des images. Ce travail est soutenu par les fonds de démarrage menant à la permanence de la faculté de médecine de l’Université de Virginie-Occidentale à R.L. Ce travail est également soutenu par le Centre d’excellence en recherche biomédicale (Vs-CoBRE) (P20GM144230) de l’Institut national des sciences médicales générales (NIGMS) et le Réseau d’excellence en recherche biomédicale de Virginie-Occidentale (WV-INBRE) (P20GM103434).

Materials

1.7 mL microcentrifuge tubes VWR 87003-294
1X FLAG Peptide GenScript N/A Custom peptide synthesis
22x22mm No. 1.5 coverslips VWR 48366-227
250 mL Conical Centrifuge Tubes Nunc 376814
250 mL Vented Erlenmyer Shaker Flask IntelixBio DBJ-SF250VP
2-Mercaptoethanol VWR M131
75x25x1 mm Vistavision microscope slides VWR 16004-42
Actin Protein (>99% Pure) Cytoskeleton AKL99
Amicon Ultra-0.5 Centrifugal Filter Unit Millipore Sigma UFC510024
Amicon Ultra-4 Centrifugal Filter Unit Millipore Sigma UFC801024
ANTI-FLAG M2 Affinity Gel Millipore Sigma A2220
ATP Millipore Sigma A7699
ATP Millipore Sigma A7699
Bio-Spin Disposable Chromatography Column Bio-Rad 732-6008
BL21 Competent E. coli New England Biolabs C2530H
Bluo-Gal Thermo Fisher 15519028
Bovine Serum Albumin Millipore Sigma 5470
BstXI Enzyme New England Biolabs R0113S
Calmodulin Millipore Sigma 208694
Catalase Millipore Sigma C40
Champion pET-SUMO Expression System Thermo Fisher K30001
cOmplete, EDTA-free Protease Inhibitor Cocktail Roche Diagnostics 5056489001
Cutsmart Buffer New England Biolabs B6004S
DL-Dithiothreitol Millipore Sigma DO632
DL-Dithiothreitol Millipore Sigma DO632
DNase I, Spectrum Chemical Fisher Scientific 18-610-304
Double-Sided Tape Office Depot 909955
EGTA, Molecular Biology Grade Millipore Sigma 324626-25GM
EGTA, Molecular Biology Grade Millipore Sigma 324626-25GM
Ethanol Thermo Fisher BP2818
ExpiFectamine Sf Transfection Reagent Gibco A38915
FAST program http://spudlab.stanford.edu/fast-for-automatic-motility-measurements; 
Fisherbrand Model 505 Sonic Dismembrator Fisher Scientific FB505110
Gentamicin Reagent Solution Gibco 15710-064 10 mg/mL in distilled water
Glucose Millipore Sigma G5767
Glucose Oxidase Millipore Sigma G2133
Glycerol Invitrogen 15514-011
HisPur Cobalt Resin Thermo Fisher 89966
I-CeuI Enzyme New England Biolabs R0699S
Image Stabilizer Plugin https://www.cs.cmu.edu/~kangli/code/Image_Stabilizer.html
ImageJ FIJI https://imagej.net/Fiji/Downloads
Imidazole Millipore Sigma I2399
In-Fusion Snap Assembly Master Mix TaKaRa 638948
IPTG Thermo Fisher 15529019
Isopropanol Fisher Scientific A451SK
Kanamycin Fisher Scientific AAJ67354AD
Large Orifice Pipet Tips Fisher Scientific 02-707-134 1-200uL
LB Agar, Ready-Made Powder Thermo Fisher J75851-A1
Leupeptin Protease Inhibitor Thermo Fisher 78435
Magnesium chloride Thermo Fisher J61014.=E 1M
Magnesium chloride Thermo Fisher J61014.=E 1M
Max Efficiency DH10Bac Competent Cells Gibco 10361012
Microcentrifuge Tubes, 1.7mL VWR 87003-294
Microcentrifuge Tubes, 1.7mL VWR 87003-294
Microcentrifuge Tubes, 1.7mL VWR 87003-294
Microscope Nikon Model: Eclipse Ti with H-TIRF system with 100X TIRF objective
Microscope Camera ORCA-Fusion BT
Microscope Laser Unit Andor iXon Ultra
Miller's LB Broth Corning 46-050-CM
MOPS Millipore Sigma M3183
MOPS Millipore Sigma M3183
NanoDrop One/OneC Microvolume UV-Vis Spectrophotometer Thermo Fisher ND-ONE-W
NanoDrop One/OneC Microvolume UV-Vis Spectrophotometer Thermo Fisher ND-ONE-W
NEB 5-alpha Competent E.coli (High Efficiency) New England Biolabs C2987H
NEBuffer r3.1 New England Biolabs B6003S
NIS Elements Nikon
NIS-Elements Nikon
Nitrocellulose LADD Research Industries 53152
Opti-MEM I Reduced Serum Medium Gibco 31985070
pACEBac1 Vector Geneva Biotech
Parafilm Millipore Sigma P7793
PMSF Millipore Sigma 78830
PureLink RNase A (20 mg/mL) Invitrogen 12091021
QIAprep Spin Miniprep Kit (250) QIAGEN 27106
QIAquick Gel Extraction Kit (50) QIAGEN 28704
QIAquick PCR Purification Kit (50) QIAGEN 28104
Quick CIP New England Biolabs M0525S
Rhodamine phalloidin Invitrogen R415
S.O.C. Medium Invitrogen 15544034
SENP2 protease PMID:17591783 Purified in the lab
Sf9 cells Thermo Fisher 11496015
Sf-900 III SFM (1X) – Serum Free Media Complete Gibco 12658-027
Slide-A-Lyzer G3 Dialysis Cassettes, 10K MWCO, 3 mL Thermo Fisher A52971
Sodium chloride Millipore Sigma S7653
Sodium chloride Millipore Sigma S7653
Stericup Quick Release Vacuum Driven Disposable Filtration System Millipore Sigma S2GPU01RE
Superdex 75 Increase 10/300 GL Cytiva 29148721
T4 DNA Ligase New England Biolabs M0202S
T4 DNA Ligase Buffer – 10X with 10mM ATP New England Biolabs B0202A
Tetracycline Hydrochloride Millipore Sigma T7660-5G
Tris Millipore Sigma 10708976001
Triton X American Bioanalytical 9002-93-1

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Citer Cet Article
Wright, M., Redford, S., Vehar, J., Courtney, K. C., Billington, N., Liu, R. MultiBac System-Based Purification and Biophysical Characterization of Human Myosin-7a. J. Vis. Exp. (210), e67135, doi:10.3791/67135 (2024).

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