Ce protocole détaille les procédures de production recombinante de l’holoenzyme myosine-7a humaine à l’aide du système de baculovirus MultiBac et d’étude de sa motilité à l’aide d’un test de glissement de filament in vitro sur mesure.
La myosine-7a est une protéine motrice basée sur l’actine essentielle aux processus auditifs et visuels. Les mutations de la myosine-7a conduisent au syndrome d’Usher de type 1, la forme la plus courante et la plus grave de surdicécité chez l’homme. On suppose que la myosine-7a forme un complexe d’adhésion transmembranaire avec d’autres protéines Usher, essentiel à l’intégrité structurelle et fonctionnelle des cellules photoréceptrices et des cellules ciliées cochléaires. Cependant, en raison des défis liés à l’obtention de protéines pures et intactes, les mécanismes fonctionnels exacts de la myosine-7a humaine restent insaisissables, avec peu d’études structurelles et biomécaniques disponibles. Des études récentes ont montré que la myosine-7a de mammifère est un complexe moteur multimérique composé d’une chaîne lourde et de trois types de chaînes légères : la chaîne légère régulatrice (RLC), la calmoduline et la protéine 4 de type calmoduline (CALML4). Contrairement à la calmoduline, CALML4 ne se lie pas aux ions calcium. Les calmodulines, sensibles au calcium et insensibles, sont essentielles à la myosine-7a de mammifère pour un bon réglage fin de ses propriétés mécaniques. Ici, nous décrivons une méthode détaillée pour produire une holoenzyme humaine recombinante de myosine-7a à l’aide du système d’expression de la protéine MultiBac Baculovirus. Cela permet d’obtenir des quantités de milligrammes de protéines complètes de haute pureté, ce qui permet leur caractérisation biochimique et biophysique. Nous présentons en outre un protocole pour évaluer ses propriétés mécaniques et mobiles à l’aide de tests de motilité in vitro sur mesure et de microscopie à fluorescence. La disponibilité de la protéine myosine-7a humaine intacte, ainsi que le protocole de caractérisation fonctionnelle détaillé décrit ici, ouvrent la voie à d’autres investigations sur les aspects moléculaires de la myosine-7a dans la vision et l’audition.
Les myosines sont des protéines motrices moléculaires qui interagissent avec l’actine pour piloter de nombreux processus cellulaires 1,2,3,4. L’homme possède 12 classes et 39 gènes de la myosine5, qui sont impliqués dans un large éventail de fonctions physiologiques, telles que la contraction musculaire6 et les processus sensoriels7. Chaque molécule de myosine est un complexe multimérique composé d’une chaîne lourde et de chaînes légères. La chaîne lourde est divisée en régions de la tête, du cou et de la queue. La tête contient des sites de liaison à l’actine et aux nucléotides qui sont responsables de l’hydrolyse de l’ATP et de la génération de la force sur les filaments d’actine2. Le col est formé de plusieurs motifs IQ α-hélicoïdaux où un ensemble spécifique de chaînes lumineuses sont liés. Ensemble, ils fonctionnent comme un bras de levier pour amplifier les changements conformationnels du moteur en grands mouvements 8,9,10. La queue contient des sous-domaines spécifiques à une classe et joue un rôle régulateur dans l’ajustement de l’activité motrice de la myosine et la médiation des interactions avec les partenaires de liaison cellulaire 2,11.
La myosine humaine 7a, membre des myosines de classe 7, est essentielle aux processus auditifs et visuels12,13. Les motifs IQ de la myosine-7a humaine sont associés à une combinaison unique de chaînes légères, y compris la chaîne légère régulatrice (RLC), la calmoduline et la protéine 4 de type calmoduline (CALML4)14,15,16. En plus de stabiliser le bras de levier, ces chaînes légères régulent les propriétés mécaniques de la myosine-7a en réponse à la signalisation calcique, une caractéristique qui semble être unique à l’isoforme14 des mammifères.
Des défauts dans le gène codant pour la chaîne lourde de la myosine-7a (MYO7A/USH1B) sont responsables du syndrome d’Usher de type 1, la forme la plus grave de perte combinée de la vision et de l’ouïe chez l’homme17. De plus, le gène de la chaîne légère CALML4 fait partie des gènes candidats cartographiés pour contenir l’allèle causal de l’USH1H, une autre variante du syndrome d’Usher de type 115,18. Dans la rétine, la myosine-7a est exprimée dans l’épithélium pigmentaire rétinien et les cellules photoréceptrices13. Il a été impliqué dans la localisation des mélanosomes dans l’épithélium pigmentaire rétinien (EPR)19 et la phagocytose des disques du segment externe des photorécepteurs par les cellules EPR20. Dans l’oreille interne, la myosine-7a se trouve principalement dans les stéréocils, où elle joue un rôle essentiel dans l’établissement des faisceaux de cheveux et dans le déclenchement du processus de transduction mécano-électrique 12,21,22.
Si l’importance de la myosine-7a dans les cellules sensorielles est bien établie, ses mécanismes fonctionnels au niveau moléculaire restent mal compris. Cette lacune dans les connaissances est en partie due aux défis liés à la purification de la protéine intacte, en particulier de l’isoforme de mammifère. Récemment, des progrès significatifs ont été réalisés en utilisant le système MultiBac pour exprimer de manière recombinante l’holoenzyme14 complète de la myosine humaine 7a. Cette avancée a permis des caractérisations structurales et biophysiques de cette protéine motrice, conduisant à la découverte de plusieurs propriétés uniques de la myosine-7a humaine qui sont spécifiquement adaptées aux fonctions auditives des mammifères14,23.
Le système MultiBac est une plate-forme avancée de cellules de baculovirus/insectes spécialement conçue pour l’expression de complexes multimériques eucaryotes24,25. Une caractéristique clé de ce système est sa capacité à héberger plusieurs cassettes d’expression génique, chacune codant pour une sous-unité du complexe, au sein d’un seul baculovirus MultiBac. L’assemblage des cassettes d’expression multigénique est facilité par un module dit de multiplication : un site d’endonucléase à tête chercheuse (HE) et un site BstXI conçu par correspondance flanquant les sites de clonage multiple (MCS). Ce module permet l’assemblage itératif d’une cassette d’expression unique par restriction/ligature, en tirant parti du fait que les sites de restriction HE et BstXI sont éliminés lors de leur ligature. Dans cet article, la chaîne lourde de la myosine-7a humaine, la RLC, la calmoduline et le CALML4 sont chacun clonés dans le module de multiplication du vecteur pACEBac1 (Figure 1A), qui sont ensuite assemblés en une cassette d’expression multigénique par le processus itératif (Figure 1B). La cassette multigénique de la myosine-7a est intégrée dans le génome du baculovirus (bacmid) par la transposition de l’élément mini-Tn7 du vecteur pACEBac1 vers le site cible de la mini-attTn7 dans le génome (Figure 1C). Suivant les procédures de purification du bacmid, de production et d’amplification du baculovirus (figures 1D, E), le baculovirus recombinant myosine-7a MultiBac est préparé et peut être utilisé pour la production de protéines à grande échelle (figure 1F). De plus, les chaînes légères de myosine-7a peuvent être produites séparément chez E. coli et purifiées à l’aide d’une étiquette His6-SUMO clivable 26,27,28. Les chaînes légères purifiées sont utiles pour étudier leur dynamique de liaison et la régulation de la myosine-7a.
La protéine myosine-7a purifiée peut être soumise à des études structurales, biochimiques et biophysiques pour mieux comprendre la régulation structurelle-fonctionnelle de cette protéine motrice. De plus, ses interactions avec le réseau d’actine et d’autres protéines de liaison29 peuvent être examinées à l’aide de diverses approches de reconstitution in vitro. Les résultats de ces analyses éclaireront les propriétés biophysiques de cette myosine, conduisant à une compréhension mécaniste de la façon dont la myosine-7a entraîne les changements cytosquelettiques et, en fin de compte, façonne la morphologie et la fonction uniques des cellules sensorielles. Dans cet article, nous détaillons un flux de travail pour le test de glissement des filaments d’actine qui a été spécifiquement adapté à la myosine-7a de mammifère. Le test de glissement des filaments d’actine est un test de motilité in vitro robuste qui étudie quantitativement le mouvement des filaments d’actine fluorescents propulsés par un grand nombre de moteurs de myosine immobilisés sur une surface de lamelle 30,31,32. Les avantages de ce test comprennent sa simplicité d’installation, ses exigences minimales en matière d’équipement (un microscope à fluorescence à grand champ équipé d’un appareil photo numérique) et sa grande reproductibilité. De plus, comme le mouvement des filaments d’actine est entraîné par un groupe de moteurs de myosine immobilisés, ce test est particulièrement utile pour étudier la motilité des myosines monomères telles que la myosine-7a14,33. Les protocoles comprennent plusieurs modifications, allant des procédures expérimentales à l’analyse d’imagerie, spécifiquement adaptées aux propriétés mobiles uniques de la myosine-7a de mammifère. Grâce à la disponibilité de la protéine myosine-7a intacte et au protocole de caractérisation fonctionnelle décrit ici, cet article jette les bases d’une étude plus approfondie des rôles moléculaires de la myosine-7a dans les processus physiologiques et pathologiques.
Voici un protocole détaillé pour la production de la protéine myosine-7a humaine recombinante à partir de cellules d’insectes. Bien que le système Sf9/baculovirus ait été utilisé pour produire une variété de myosines 40,41,42,43, ce n’est que récemment que la myosine-7a de mammifère a été purifiée avec succès à l’aide du système de baculovirus MultiBac …
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions le centre d’imagerie microscopique et le centre de fonction visuelle et de morphologie de l’Université de Virginie-Occidentale pour la discussion et l’aide à l’analyse des images. Ce travail est soutenu par les fonds de démarrage menant à la permanence de la faculté de médecine de l’Université de Virginie-Occidentale à R.L. Ce travail est également soutenu par le Centre d’excellence en recherche biomédicale (Vs-CoBRE) (P20GM144230) de l’Institut national des sciences médicales générales (NIGMS) et le Réseau d’excellence en recherche biomédicale de Virginie-Occidentale (WV-INBRE) (P20GM103434).
1.7 mL microcentrifuge tubes | VWR | 87003-294 | |
1X FLAG Peptide | GenScript | N/A | Custom peptide synthesis |
22x22mm No. 1.5 coverslips | VWR | 48366-227 | |
250 mL Conical Centrifuge Tubes | Nunc | 376814 | |
250 mL Vented Erlenmyer Shaker Flask | IntelixBio | DBJ-SF250VP | |
2-Mercaptoethanol | VWR | M131 | |
75x25x1 mm Vistavision microscope slides | VWR | 16004-42 | |
Actin Protein (>99% Pure) | Cytoskeleton | AKL99 | |
Amicon Ultra-0.5 Centrifugal Filter Unit | Millipore Sigma | UFC510024 | |
Amicon Ultra-4 Centrifugal Filter Unit | Millipore Sigma | UFC801024 | |
ANTI-FLAG M2 Affinity Gel | Millipore Sigma | A2220 | |
ATP | Millipore Sigma | A7699 | |
ATP | Millipore Sigma | A7699 | |
Bio-Spin Disposable Chromatography Column | Bio-Rad | 732-6008 | |
BL21 Competent E. coli | New England Biolabs | C2530H | |
Bluo-Gal | Thermo Fisher | 15519028 | |
Bovine Serum Albumin | Millipore Sigma | 5470 | |
BstXI Enzyme | New England Biolabs | R0113S | |
Calmodulin | Millipore Sigma | 208694 | |
Catalase | Millipore Sigma | C40 | |
Champion pET-SUMO Expression System | Thermo Fisher | K30001 | |
cOmplete, EDTA-free Protease Inhibitor Cocktail | Roche Diagnostics | 5056489001 | |
Cutsmart Buffer | New England Biolabs | B6004S | |
DL-Dithiothreitol | Millipore Sigma | DO632 | |
DL-Dithiothreitol | Millipore Sigma | DO632 | |
DNase I, Spectrum Chemical | Fisher Scientific | 18-610-304 | |
Double-Sided Tape | Office Depot | 909955 | |
EGTA, Molecular Biology Grade | Millipore Sigma | 324626-25GM | |
EGTA, Molecular Biology Grade | Millipore Sigma | 324626-25GM | |
Ethanol | Thermo Fisher | BP2818 | |
ExpiFectamine Sf Transfection Reagent | Gibco | A38915 | |
FAST program | http://spudlab.stanford.edu/fast-for-automatic-motility-measurements; | ||
Fisherbrand Model 505 Sonic Dismembrator | Fisher Scientific | FB505110 | |
Gentamicin Reagent Solution | Gibco | 15710-064 | 10 mg/mL in distilled water |
Glucose | Millipore Sigma | G5767 | |
Glucose Oxidase | Millipore Sigma | G2133 | |
Glycerol | Invitrogen | 15514-011 | |
HisPur Cobalt Resin | Thermo Fisher | 89966 | |
I-CeuI Enzyme | New England Biolabs | R0699S | |
Image Stabilizer Plugin | https://www.cs.cmu.edu/~kangli/code/Image_Stabilizer.html | ||
ImageJ FIJI | https://imagej.net/Fiji/Downloads | ||
Imidazole | Millipore Sigma | I2399 | |
In-Fusion Snap Assembly Master Mix | TaKaRa | 638948 | |
IPTG | Thermo Fisher | 15529019 | |
Isopropanol | Fisher Scientific | A451SK | |
Kanamycin | Fisher Scientific | AAJ67354AD | |
Large Orifice Pipet Tips | Fisher Scientific | 02-707-134 | 1-200uL |
LB Agar, Ready-Made Powder | Thermo Fisher | J75851-A1 | |
Leupeptin Protease Inhibitor | Thermo Fisher | 78435 | |
Magnesium chloride | Thermo Fisher | J61014.=E | 1M |
Magnesium chloride | Thermo Fisher | J61014.=E | 1M |
Max Efficiency DH10Bac Competent Cells | Gibco | 10361012 | |
Microcentrifuge Tubes, 1.7mL | VWR | 87003-294 | |
Microcentrifuge Tubes, 1.7mL | VWR | 87003-294 | |
Microcentrifuge Tubes, 1.7mL | VWR | 87003-294 | |
Microscope | Nikon | Model: Eclipse Ti with H-TIRF system with 100X TIRF objective | |
Microscope Camera | ORCA-Fusion BT | ||
Microscope Laser Unit | Andor iXon Ultra | ||
Miller's LB Broth | Corning | 46-050-CM | |
MOPS | Millipore Sigma | M3183 | |
MOPS | Millipore Sigma | M3183 | |
NanoDrop One/OneC Microvolume UV-Vis Spectrophotometer | Thermo Fisher | ND-ONE-W | |
NanoDrop One/OneC Microvolume UV-Vis Spectrophotometer | Thermo Fisher | ND-ONE-W | |
NEB 5-alpha Competent E.coli (High Efficiency) | New England Biolabs | C2987H | |
NEBuffer r3.1 | New England Biolabs | B6003S | |
NIS Elements | Nikon | ||
NIS-Elements | Nikon | ||
Nitrocellulose | LADD Research Industries | 53152 | |
Opti-MEM I Reduced Serum Medium | Gibco | 31985070 | |
pACEBac1 Vector | Geneva Biotech | ||
Parafilm | Millipore Sigma | P7793 | |
PMSF | Millipore Sigma | 78830 | |
PureLink RNase A (20 mg/mL) | Invitrogen | 12091021 | |
QIAprep Spin Miniprep Kit (250) | QIAGEN | 27106 | |
QIAquick Gel Extraction Kit (50) | QIAGEN | 28704 | |
QIAquick PCR Purification Kit (50) | QIAGEN | 28104 | |
Quick CIP | New England Biolabs | M0525S | |
Rhodamine phalloidin | Invitrogen | R415 | |
S.O.C. Medium | Invitrogen | 15544034 | |
SENP2 protease | PMID:17591783 | Purified in the lab | |
Sf9 cells | Thermo Fisher | 11496015 | |
Sf-900 III SFM (1X) – Serum Free Media Complete | Gibco | 12658-027 | |
Slide-A-Lyzer G3 Dialysis Cassettes, 10K MWCO, 3 mL | Thermo Fisher | A52971 | |
Sodium chloride | Millipore Sigma | S7653 | |
Sodium chloride | Millipore Sigma | S7653 | |
Stericup Quick Release Vacuum Driven Disposable Filtration System | Millipore Sigma | S2GPU01RE | |
Superdex 75 Increase 10/300 GL | Cytiva | 29148721 | |
T4 DNA Ligase | New England Biolabs | M0202S | |
T4 DNA Ligase Buffer – 10X with 10mM ATP | New England Biolabs | B0202A | |
Tetracycline Hydrochloride | Millipore Sigma | T7660-5G | |
Tris | Millipore Sigma | 10708976001 | |
Triton X | American Bioanalytical | 9002-93-1 |
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