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Análisis de experimentos multifactoriales de RNA-Seq con DiCoExpress
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05:22 min
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July 29, 2022
DOI:
1Université Paris-Saclay, CNRS, INRAE, Univ Evry, Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2), Orsay, France, 2Université de Paris, CNRS, INRAE, Institute of Plant Sciences Paris Saclay (IPS2), Orsay, France, 3Université Paris-Saclay, INRAE, CNRS, AgroParisTech, GQE – Le Moulon, Gif-sur-Yvette, France, 4LSTM, Univ Montpellier, INRAE, IRD, CIRAD, Institut Agro, Montpellier, France, 5Universitté Paris-Saclay, AgroParisTech, INRAE, UMR MIA-Paris, Paris, France
Summary
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DiCoExpress es una herramienta basada en scripts implementada en R para realizar un análisis RNA-Seq desde el control de calidad hasta la coexpresión. DiCoExpress maneja un diseño completo y desequilibrado de hasta 2 factores biológicos. Este video tutorial guía al usuario a través de las diferentes características de DiCoExpress.
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Baudry, K., Paysant-Le Roux, C., Colella, S., Castandet, B., Martin, M. Analyzing Multifactorial RNA-Seq Experiments with DiCoExpress. J. Vis. Exp. (185), e62566, doi:10.3791/62566 (2022).
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