Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido. Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
Multifactoriële RNA-Seq-experimenten analyseren met DiCoExpress
2,248 Views
•
05:22 min
•
July 29, 2022
DOI:
1Université Paris-Saclay, CNRS, INRAE, Univ Evry, Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2), Orsay, France, 2Université de Paris, CNRS, INRAE, Institute of Plant Sciences Paris Saclay (IPS2), Orsay, France, 3Université Paris-Saclay, INRAE, CNRS, AgroParisTech, GQE – Le Moulon, Gif-sur-Yvette, France, 4LSTM, Univ Montpellier, INRAE, IRD, CIRAD, Institut Agro, Montpellier, France, 5Universitté Paris-Saclay, AgroParisTech, INRAE, UMR MIA-Paris, Paris, France
Summary
Automatically generated
DiCoExpress is een script-gebaseerde tool geïmplementeerd in R om een RNA-Seq analyse uit te voeren van kwaliteitscontrole tot co-expressie. DiCoExpress verwerkt een compleet en onevenwichtig ontwerp tot 2 biologische factoren. Deze videozelfstudie leidt de gebruiker door de verschillende functies van DiCoExpress.
Read Article
Cite this Article
Baudry, K., Paysant-Le Roux, C., Colella, S., Castandet, B., Martin, M. Analyzing Multifactorial RNA-Seq Experiments with DiCoExpress. J. Vis. Exp. (185), e62566, doi:10.3791/62566 (2022).
Copy