Journal
/
Biología
/
Червь выравнивания и Worm_CP, два трубопровода с открытым исходным кодом для выпрямления и количественной оценки флуоресценции изображения данных, полученных от Caenorhabditis elegans
JoVE Revista
Biología
This content is Free Access.
JoVE Revista Biología
Worm-align and Worm_CP, Two Open-Source Pipelines for Straightening and Quantification of Fluorescence Image Data Obtained from Caenorhabditis elegans
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Червь выравнивания и Worm_CP, два трубопровода с открытым исходным кодом для выпрямления и количественной оценки флуоресценции изображения данных, полученных от Caenorhabditis elegans

DOI:
10.3791/61136-v

•

11:16 min

•

May 28, 2020

•

, , , ,
1Babraham Institute

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 00:57Mounting Fixed Worms for Imaging
  • 02:56Creating Montage Images of Aligned Single Worms Using the Worm-align FIJI Pipeline
  • 06:01Analyzing Single-worm Fluorescence Intensity Using the Output from Worm-align in an Automated CellProfiler Pipeline
  • 08:07Results: Fluorescence Quantification with the Worm_CP Pipeline
  • 09:50Conclusion

Summary

Traducción Automática

Traducción Automática

Worm-align/Worm_CP - это простой рабочий процесс FIJI/CellProfiler, который может быть использован для выпрямления и выравнивания образцов Caenorhabditis elegans и оценки анализа изображений на основе всего червя без необходимости предварительного обучения. Мы применили Worm-align/Worm_CP к количественной оценке теплового шока индуцированного выражения у живых животных или липидных капель в фиксированных образцах.

Tags

Worm-alignWorm CPCaenorhabditis ElegansFluorescence Image DataStraighteningQuantificationFijiCellProfilerMouth MicropipetteMounting MediumAgarose PadLevamisoleImage Analysis

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

Изображений С. Элеганс Эмбрионы использованием Epifluorescent Микроскоп и открытое программное обеспечение

Vampiric выделение внеклеточной жидкости из<em> Caenorhabditis Элеганс</em

Основной<em> Caenorhabditis Элеганс</em> Методы синхронизации и наблюдения

Workflow для высокого содержания, отдельная клетка количественной флуоресцентных маркеров из Всеобщей микроскоп данных, поддерживаемые ПО с открытым кодом

Отслеживание и Количественная процессов развития в<em> С. Элеганс</em> Использование инструментов с открытым кодом

Наблюдение и Количественная теломер и повторяющихся последовательностей с помощью флуоресцентной<em> В Ситу</em> Гибридизация (FISH) с зондами PNA<em> Caenorhabditis Элеганс</em

Open Source High Content Analysis Используя Автоматизированное время жизни флюоресценции визуализации микроскопии

С открытым исходным кодом Анализ Одночастичного для супер-разрешение микроскопии с VirusMapper

Количественное определение липидного изобилия и оценки распределения липидов в Caenorhabditis elegans Нила красный и нефти красный O пятнать

IR-TEx: Инструмент интеграции данных с открытым исходным кодом для транскриптомики больших данных, предназначенный для гамбии переносчика малярии Anopheles

Read Article