Vi beskriver en immunofluorescens och kvantitativ PCR-metod för lokalisering och kvantifiering av begomovirus i insektsvävnader. Immunofluorescensprotokollet kan användas för att kolokalisera virus- och vektorproteiner. Det kvantitativa PCR-protokollet kan utvidgas till att kvantifiera virus i hela whitefly-kroppar och virusinfekterade växter.