Journal
/
Genética
/
Identifisering av fotavtrykk av RNA: protein komplekser via RNA-Immunutfelling i tandem etterfulgt av sekvensering (RIPiT-SEQ)
JoVE Revista
Genética
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Genética
Identification of Footprints of RNA:Protein Complexes via RNA Immunoprecipitation in Tandem Followed by Sequencing (RIPiT-Seq)

Identifisering av fotavtrykk av RNA: protein komplekser via RNA-Immunutfelling i tandem etterfulgt av sekvensering (RIPiT-SEQ)

DOI:
10.3791/59913-v

•

09:26 min

•

July 10, 2019

•

, ,
1Department of Molecular Genetics, Center for RNA Biology,The Ohio State University

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:40Cell Harvesting and Formaldehyde Treatment
  • 02:50FLAG Immunoprecipitation and RNase I Digestion
  • 04:09Affinity Elution and Magnetic Bead-antibody Conjugation
  • 05:14Second Immunoprecipitation
  • 06:12RNA Extraction and Analysis
  • 07:51Results: RNA and Protein Yields
  • 08:38Conclusion

Summary

Traducción Automática

Traducción Automática

Her presenterer vi en protokoll for å berike endogene RNA bindende nettsteder eller "fotavtrykk" av RNA: protein (RNP) komplekser fra pattedyrceller. Denne tilnærmingen innebærer to immunoprecipitations av RNP under enheter og er derfor kalt RNA immunutfelling i tandem (RIPiT).

Tags

RNA ImmunoprecipitationRIPiT-SeqRNA-protein ComplexesEpitope-tagged ProteinCRISPRImmunoprecipitationRNA ExtractionHEK293 CellsRNA Binding ProteinsRNA ProcessingDiseasesNeuropathiesCancer

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

Generasjon av innfødte Chromatin Immunoprecipitation sekvensering biblioteker til Nucleosome tetthet analyse

Undersøkelse av RNA syntese med 5-Bromouridine merking og Immunoprecipitation

Sjelden hendelse gjenkjenning feil-korrigert DNA og RNA sekvensering

Kunstig RNA polymerase II forlengelse komplekser for dissekere co-transcriptional RNA prosessering hendelser

Single-Cell RNA sekvensering og analyse av Human bukspyttkjertelen holmer

Identifikasjon av sirkulær RNAs ved hjelp av RNA-sekvensering

Tomatrottransformasjon etterfulgt av inokulasjon med Ralstonia Solanacearum for enkel genetisk analyse av bakteriell wiltsykdom

Screening og identifisering av RNA-dempende suppressorer fra utskillede effektorer av plantepatogener

Transkripsjonsomfattende profilering av protein-RNA interaksjoner ved krysskobling og immunoprecipitation mediert av FLAG-Biotin Tandem rensing

Oppdagelse CsgD regulere mål inne Salmonella biofilm benytter kromatin Immunutfelling og høy-produksjon sekvensering (flis-SEQ)

Read Article