Journal
/
Genética
/
Identifikation af fodspor af RNA: protein komplekser via RNA Immunopræcipitation i tandem efterfulgt af sekventering (RIPiT-SEQ)
JoVE Revista
Genética
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Genética
Identification of Footprints of RNA:Protein Complexes via RNA Immunoprecipitation in Tandem Followed by Sequencing (RIPiT-Seq)

Identifikation af fodspor af RNA: protein komplekser via RNA Immunopræcipitation i tandem efterfulgt af sekventering (RIPiT-SEQ)

DOI:
10.3791/59913-v

•

09:26 min

•

July 10, 2019

•

, ,
1Department of Molecular Genetics, Center for RNA Biology,The Ohio State University

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:40Cell Harvesting and Formaldehyde Treatment
  • 02:50FLAG Immunoprecipitation and RNase I Digestion
  • 04:09Affinity Elution and Magnetic Bead-antibody Conjugation
  • 05:14Second Immunoprecipitation
  • 06:12RNA Extraction and Analysis
  • 07:51Results: RNA and Protein Yields
  • 08:38Conclusion

Summary

Traducción Automática

Traducción Automática

Her præsenterer vi en protokol for at berige endogene RNA-bindingssteder eller "fodspor" af RNA: protein (RNP)-komplekser fra pattedyrsceller. Denne fremgangsmåde involverer to immunoprecipitationer af RNP under enheder og er derfor døbt RNA chromatinimmunpræcipitation i tandem (ripit).

Tags

RNA ImmunoprecipitationRIPiT-SeqRNA-protein ComplexesEpitope-tagged ProteinCRISPRImmunoprecipitationRNA ExtractionHEK293 CellsRNA Binding ProteinsRNA ProcessingDiseasesNeuropathiesCancer

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

Generation af indfødte kromatin Immunoprecipitation sekventering biblioteker for Nucleosome tæthed analyse

Undersøgelse af RNA syntese ved hjælp af 5-Bromouridine mærkning og Immunoprecipitation

Sjælden begivenhed registrering ved hjælp af fejl-korrigeret DNA og RNA sekventering

Kunstige RNA polymerase II forlængede komplekser til dissekering af co-transkriptionelle RNA-behandlings hændelser

Enkelt celle-RNA-sekvensering og analyse af humane bugspytkirtel-øer

Identifikation af cirkulære RNAs ved hjælp af RNA-sekvensering

Tomatrod Transformation Efterfulgt af podning med Ralstonia Solanacearum for ligetil genetisk analyse af bakteriel visnesygdom

Screening og identifikation af RNA-lyddæmpningsundertrykkere fra udskillede effektorer af plantepatogener

Transkription-wide profilering af Protein-RNA interaktioner ved cross-linking og immunoprecipation medieret af FLAG-Biotin Tandem Rensning

Opdagelse af CsgD-regulatoriske mål i salmonella biofilm ved hjælp af kromatin Immunopræcipitation og High-gennemløb Sequencing (ChIP-SEQ)

Read Article