Journal
/
Genética
/
Een bioinformatica-pijpleiding om de MicroRNA Transcriptomes in fabrieken nauwkeurig en efficiënt te analyseren
JoVE Revista
Genética
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Genética
A Bioinformatics Pipeline to Accurately and Efficiently Analyze the MicroRNA Transcriptomes in Plants
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Een bioinformatica-pijpleiding om de MicroRNA Transcriptomes in fabrieken nauwkeurig en efficiënt te analyseren

DOI:
10.3791/59864-v

•

06:34 min

•

January 21, 2020

•

, , ,
1Beijing Key Laboratory of Agricultural Genetic Resources and Biotechnology, Beijing Agro-Biotechnology Research Center,Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, 2State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, School of Advanced Agricultural Sciences and School of Life Sciences,Peking University

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:15Installation and Testing
  • 02:56Identifying Novel MicroRNAs (miRNAs)
  • 03:33Reference Index Building
  • 04:42Results: Representative miRDP2 Performance
  • 05:45Conclusion

Summary

Traducción Automática

Traducción Automática

Een bioinformatica-pijpleiding, namelijk miRDeep-P2 (kortweg miRDP2), met bijgewerkte plant miRNA-criteria en een gereviseerd algoritme, kan microRNA transcriptomes nauwkeurig en efficiënt analyseren in planten, vooral voor soorten met complexe en grote Genomes.

Tags

Bioinformatics PipelineMicroRNA TranscriptomesPlantsMiRDeep2Plant MicroRNAsTranscriptional RegulatorsPlant DevelopmentEnvironmental ChallengesFalse PositivesProcessing TimeHigh Confidence MicroRNA AnnotationGenome FunctionMiRDeep2 PipelineArabidopsis ThalianaGenome Reference IndexNoncoding RNA Reference IndexDeep Sequencing ReadsAdaptersFASTA Identifiers

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

-Peptide afgeleide methode om genen en eiwitten Across Cellulaire en organellen Barriers in Planten Transport

Detectie van Copy Number Wijzigingen met behulp van Single Cell Sequencing

Systemische levering van MicroRNA met behulp van Recombinant Adeno-associated Virus Serotype 9 voor de behandeling van neuromusculaire ziekten bij knaagdieren

Een Optogenetic methode te controleren en analyseren van gen expressiepatronen in cel-naar-cel interacties

Next-generation Sequencing en Bioinformatics pijpleiding om te evalueren van genetische determinanten van constitutionele ziekte gericht

Een snelle en Facile pijpleiding voor het genereren van Genomic punt mutanten in C. elegans met behulp van CRISPR/Cas9 Ribonucleoproteins

Isolatie, karakterisering en MicroRNA gebaseerde genetische modificatie van stamcellen van menselijke tandheelkundige follikel

Met behulp van In Vitro en In cel vorm te onderzoeken klein molecuul veroorzaakte structurele veranderingen van de Pre-mRNA

Karakterisering van Histone posttranslationele wijziging wijzigingen in gist neurodegeneratieve Proteinopathy modellen

Verbeterde gist One-hybride schermen te identificeren van de transcriptiefactor binden aan menselijke DNA-sequenties

Read Article