Single-cell RNA Sequencing of Fluorescently Labeled Mouse Neurons Using Manual Sorting and Double <em>In Vitro</em> Transcription with Absolute Counts Sequencing (DIVA-Seq)

Anirban Paul; Z. Josh Huang

doi:10.3791/58690

/

Encellede RNA sekventering af Fluorescently mærket mus neuroner ved hjælp af manuel sortering og dobbelt In Vitro transskription med absolut tæller sekventering (DIVA-Seq)

JoVE Revista
Neurociencias

Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido. Inicie sesión o comience su prueba gratuita.

JoVE Revista Neurociencias

Single-cell RNA Sequencing of Fluorescently Labeled Mouse Neurons Using Manual Sorting and Double In Vitro Transcription with Absolute Counts Sequencing (DIVA-Seq)

Encellede RNA sekventering af Fluorescently mærket mus neuroner ved hjælp af manuel sortering og dobbelt In Vitro transskription med absolut tæller sekventering (DIVA-Seq)

DOI:

10.3791/58690-v

•

07:49 min

•

October 26, 2018

•

Anirban Paul, Z. Josh Huang

¹Cold Spring Harbor Laboratory

Capítulos

00:04Título
00:43Preparation for Dissection and Neuron Sorting
02:09Brain Sectioning and Cell Dissociation
04:15Manual Sorting of Fluorescently Labeled Mouse Neurons
05:59Results: Microdissection of GABAergic Neurons
07:24Conclusion

Summary

Traducción Automática

Denne protokol beskriver den manuelle sortering procedure for at isolere enkelt fluorescently mærket neuroner efterfulgt af in vitro- transskription-baserede mRNA forstærkning til høj-dybde encellede RNA sekvensering.

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

Ikke-Laser Capture Mikroskopi Tilgang til mikrodissektion af diskrete Mouse Brain Regioner for Total RNA Isolation og downstream næste generation sekventering og Gene Expression Profiling

Profiling Voltage-gated Potassium Channel mRNA Expression in Nigral Neurons using Single-cell RT-PCR Techniques

Enkelt-celle Profilering af at udvikle og Ældre retinaneuroner

Real-time Imaging af axonal Transport af Quantum Dot-mærket BDNF i Primary neuroner

Pålidelig Identifikation af Living dopaminerge neuroner i midthjernen Cultures Brug RNA Sequencing og TH-promotor-drevet eGFP Expression

Single-cell RNA-Seq af definerede subsæt af retinale Ganglion-celler

En In Vivo blod - hjerne barrieren permeabilitet Assay i mus ved hjælp af Fluorescently mærket røbestoffer

At identificere transskription faktor Olig2 genomisk bindingssteder i akut renset PDGFRα + celler ved lav-celle kromatin Immunoprecipitation sekventering analyse