Ici, nous présentons un protocole pour l'imagerie en direct de la fusion palatine secondaire de souris à l'aide d'une microscopie confocale. Ce protocole peut être utilisé en combinaison avec une variété de lignes de souris rapporteurs fluorescentes et avec des inhibiteurs de voie pour une vision mécaniste. Ce protocole peut être adapté pour l'imagerie en direct dans d'autres systèmes de développement.