Riktlinjer för datorbaserad strukturella och funktionella karakterisering av protein med hjälp av I-TASSER pipeline beskrivs. Från frågan protein sekvens, är 3D-modeller skapas med hjälp av flera gängning väglinjer och iterativ konstruktionsmontering simuleringar. Funktionella slutsatser som därefter dras baserade på matcher till proteiner med känd struktur och funktioner.