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Un protocolo para la estructura de la proteína por computadora y la función de predicción
JoVE Revista
Biología
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JoVE Revista Biología
A Protocol for Computer-Based Protein Structure and Function Prediction
DOI:

16:41 min

November 03, 2011

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Capítulos

  • 00:05Título
  • 02:21Running the I-TASSER Server
  • 03:37Structure Analysis
  • 05:58LOMETS Target Template Alignment
  • 07:30Structural Analogs in PDB and Enzyme Commission Number Prediction
  • 09:20Gene Ontology (GO) Term and Protein-ligand Bind site Predictions
  • 12:05Representative I-TASSER Results
  • 15:43Conclusion

Summary

Traducción Automática

Directrices para el ordenador basado en la caracterización estructural y funcional de la proteína mediante la canalización I-TASSER se describe. A partir de secuencias de proteínas de la consulta, los modelos 3D se generan con múltiples alineaciones threading e iterativo simulaciones estructurales de montaje. Inferencias funcionales a partir de entonces son elaborados sobre la base de los partidos a las proteínas de estructura conocida y funciones.

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