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コンピュータベースのタンパク質の構造と機能の予測のためのプロトコル
JoVE Revista
Biología
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JoVE Revista Biología
A Protocol for Computer-Based Protein Structure and Function Prediction
DOI:

16:41 min

November 03, 2011

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Capítulos

  • 00:05Título
  • 02:21Running the I-TASSER Server
  • 03:37Structure Analysis
  • 05:58LOMETS Target Template Alignment
  • 07:30Structural Analogs in PDB and Enzyme Commission Number Prediction
  • 09:20Gene Ontology (GO) Term and Protein-ligand Bind site Predictions
  • 12:05Representative I-TASSER Results
  • 15:43Conclusion

Summary

Traducción Automática

I - TASSERのパイプラインを使用してタンパク質の構造と機能解析に基づくコンピューターのためのガイドラインが記述されています。クエリタンパク質配列から始まる、3Dモデルは、複数のスレッドアラインメントを使用して生成され、構造組立シミュレーションを反復している。機能的な推論は、その後、既知の構造と機能を持つ蛋白質の一致に基づいて描画されます。

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