Journal
/
Biología
/
Een protocol voor Computer-Based Protein Structure en functie Voorspelling
JoVE Revista
Biología
This content is Free Access.
JoVE Revista Biología
A Protocol for Computer-Based Protein Structure and Function Prediction
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Een protocol voor Computer-Based Protein Structure en functie Voorspelling

DOI:
10.3791/3259-v

•

16:41 min

•

November 03, 2011

•

, , ,
1Center for Computational Medicine and Bioinformatics,University of Michigan , 2Center for Bioinformatics and Department of Molecular Bioscience,University of Kansas

Capítulos

  • 00:05Título
  • 02:21Running the I-TASSER Server
  • 03:37Structure Analysis
  • 05:58LOMETS Target Template Alignment
  • 07:30Structural Analogs in PDB and Enzyme Commission Number Prediction
  • 09:20Gene Ontology (GO) Term and Protein-ligand Bind site Predictions
  • 12:05Representative I-TASSER Results
  • 15:43Conclusion

Summary

Traducción Automática

Traducción Automática

Richtlijnen voor de computer op basis van structurele en functionele karakterisering van eiwitten met behulp van de I-TASSER pijplijn is beschreven. Vanaf vraag eiwitsequentie, zijn 3D-modellen gegenereerd met behulp van meerdere threading uitlijningen en iteratief structurele assemblage simulaties. Functionele gevolgtrekkingen worden daarna getrokken op basis van wedstrijden om eiwitten met bekende structuur en functies.

Tags

ProtocolComputer-basedProtein StructureFunction PredictionGenome Sequencing ProjectsProtein SequenceStructure And Function KnowledgeExperimental MethodsComputational ModelingI-TASSER ServerSecondary Structure PredictionSolvent Accessibility PredictionHomologous Template ProteinsStructure AlignmentsTertiary Structural ModelsStructure-based Functional AnnotationsConfidence ScoreEnd UsersUser-specified Inter-residue DistanceContact MapsI-TASSER ModelingTemplate ProteinsStructure Assembly Simulations

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

check_url/es/3259?article_type=v

Het belang van correcte eiwitconcentratie voor Kinetics en affiniteit Bepaling in structuur-functie analyse
check_url/es/3259?article_type=v

Met behulp van de GELFREE 8100 Fractionering System for Molecular Weight-Based Fractionering met Liquid Phase Recovery
check_url/es/3259?article_type=v

Analyse van de ontwikkeling van een morfologische fenotype als een functie van de eiwitconcentratie in gist
check_url/es/3259?article_type=v

Een protocol voor de identificatie van eiwit-eiwit interacties op basis van<sup> 15</sup> N Metabole Labeling, Immunoprecipitatie, kwantitatieve Massaspectrometrie en Affiniteit Modulatie
check_url/es/3259?article_type=v

Met behulp van hoge resolutie Computed Tomography om de driedimensionale structuur en functie van Plant vaatstelsel Visualiseer
check_url/es/3259?article_type=v

RNA secundaire structuur Voorspelling behulp van High-throughput SHAPE
check_url/es/3259?article_type=v

Een protocol voor faag display en Affiniteit selectie met recombinant eiwit Baits
check_url/es/3259?article_type=v

Onderzoeken eiwit-eiwit interacties in levende cellen met behulp van bioluminescentie resonantie energieoverbrenging
check_url/es/3259?article_type=v

Het ontdekken van eiwit interacties en karakteriseren Eiwit-functie gebruiken HaloTag Technology
check_url/es/3259?article_type=v

Functionele Het oplossen en Channel activiteit Metingen van gezuiverde wildtype en mutante CFTR eiwit

Read Article