Detta protokoll introducerar steg för metabarkodningsanalys, med inriktning på 16S rRNA- och 18S rRNA-gener, för övervakning av skadliga algblomningar och deras tillhörande mikrobiom i havsvattenprover. Det är ett kraftfullt molekylärt baserat verktyg men kräver flera procedurer, som förklaras visuellt här steg för steg.