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마이크로바이옴 데이터에서 선형 판별 분석 효과 크기(LEfSe)에 의한 바이오마커 보조 선택
13,841 Views
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04:57 min
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May 16, 2022
DOI:
1Marine Resources Research Centre,Tianjin Research Institute for Water Transport Engineering, M.O.T., 2Key Laboratory of Regional Energy Systems Optimization, Ministry of Education, College of Environmental Science and Engineering,North China Electric Power University, 3School of Environmental Science and Engineering,Huazhong University of Science and Technology
Summary
Automatically generated
LEfSe (LDA 효과 크기)는 미생물 데이터에서 둘 이상의 그룹을 유의하게 특성화하는 게놈 특징 (예 : 유전자, 경로 및 분류법)을 확인하기 위해 고차원 바이오마커 마이닝을위한 도구입니다.
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Cite this Article
Chang, F., He, S., Dang, C. Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data. J. Vis. Exp. (183), e61715, doi:10.3791/61715 (2022).
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