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Unterstützte Auswahl von Biomarkern durch lineare Diskriminanzanalyse-Effektgröße (LEfSe) in Mikrobiomdaten
13,841 Views
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04:57 min
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May 16, 2022
DOI:
1Marine Resources Research Centre,Tianjin Research Institute for Water Transport Engineering, M.O.T., 2Key Laboratory of Regional Energy Systems Optimization, Ministry of Education, College of Environmental Science and Engineering,North China Electric Power University, 3School of Environmental Science and Engineering,Huazhong University of Science and Technology
Summary
Automatically generated
LEfSe (LDA Effect Size) ist ein Werkzeug für das hochdimensionale Biomarker-Mining zur Identifizierung genomischer Merkmale (wie Gene, Signalwege und Taxonomien), die zwei oder mehr Gruppen in Mikrobiomdaten signifikant charakterisieren.
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Chang, F., He, S., Dang, C. Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data. J. Vis. Exp. (183), e61715, doi:10.3791/61715 (2022).
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