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Un pipeline de bioinformatique pour analyser avec précision et efficacité les transcriptomes microARN dans les plantes
1Beijing Key Laboratory of Agricultural Genetic Resources and Biotechnology, Beijing Agro-Biotechnology Research Center,Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, 2State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, School of Advanced Agricultural Sciences and School of Life Sciences,Peking University
Kapitel
- 00:04Titel
- 01:15Installation and Testing
- 02:56Identifying Novel MicroRNAs (miRNAs)
- 03:33Reference Index Building
- 04:42Results: Representative miRDP2 Performance
- 05:45Conclusion
Un pipeline bioinformatique, à savoir miRDeep-P2 (miRDP2 pour faire court), avec des critères de miARN végétal mis à jour et un algorithme révisé, pourrait analyser avec précision et efficacité les transcriptomes de microARN chez les plantes, en particulier pour les espèces ayant des génomes complexes et volumineux.
Tags
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