OpenProt er en frit tilgængelig database, der gennemtvinger en polycistronic model af eukaryote genomer. Vi præsenterer her, en protokol til brug af OpenProt databaser når spørgekriterierne massespektrometri datasæt. Ved hjælp af OpenProt database til analyse af proteom eksperimenter giver mulighed for opdagelsen af romanen og tidligere målbart proteiner.