Здесь подробно описаны протоколы для выполнения микрофокусированной рентгеновской компьютерной томографии (микроКТ) изображений трех морских беспозвоночных животных. В этом исследовании описаны такие этапы, как фиксация образцов, окрашивание, монтаж, сканирование, реконструкция изображений и анализ данных. Предложения о том, как протокол может быть скорректирован для различных образцов также представлены.