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Isolamento ed analisi di comunità microbiche nel suolo, rizosfera e radici negli esperimenti di erba perenne
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Isolation and Analysis of Microbial Communities in Soil, Rhizosphere, and Roots in Perennial Grass Experiments
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Isolamento ed analisi di comunità microbiche nel suolo, rizosfera e radici negli esperimenti di erba perenne

DOI:
10.3791/57932-v

•

10:31 min

•

July 24, 2018

•

, , , ,
1Department of Agronomy and Horticulture and Center for Plant Science Innovation,University of Nebraska-Lincoln, 2USDA-ARS, Wheat, Sorghum and Forage Research Unit,University of Nebraska-Lincoln East Campus

Kapitel

  • 00:04Titel
  • 00:36Plant Excavation, Soil Removal, and Bulk Soil Collection
  • 01:46Root and Rhizosphere Collection
  • 02:44Root Surface Sterilization
  • 03:54Processing Rhizosphere Samples
  • 05:02DNA Extraction and Soil Analysis Processing
  • 06:33DNA Extraction in 96-well Format
  • 07:45Rhizosphere Sample Loading
  • 08:47Results: Visualization and Statistical Methods Highlight Differences in Microbial Community Composition and Diversity Between Sample Types and Grass Species
  • 10:03Conclusion

Summary

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Scavo delle radici delle piante dal campo e trattamento dei campioni in endosphere, rizosfera e suolo sono descritte in dettaglio, compresi i metodi di analisi di dati e di estrazione del DNA. Questa carta è progettata per consentire altri laboratori di utilizzare queste tecniche per lo studio del suolo, endosphere e rizosfera microbiomi.

Tags

Keywords: Microbial CommunitiesSoilRhizosphereRoot EndospherePerennial GrassField ExperimentsSample CollectionSoil SamplingRoot SamplingRhizosphere ExtractionRoot SterilizationMicrobiome Analysis

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