Aquí se describe un protocolo para la manipulación optogenética de la actividad motoneuronal mientras monitoriza los cambios en la salida del motor (contracción muscular) en semi-intacta<em> Drosophila</em> Larvas de uso de láser dentro de un microscopio confocal convencional. Esta técnica permite a los investigadores para lograr perturbación local de la actividad neuronal en algunas neuromeres para dilucidar la dinámica de circuitos de motor.