Полный процесс от мозга подготовки образца до серийного секционирования визуализации с использованием ножа сканирующий микроскоп, для визуализации и анализа данных описывается. Эта техника в настоящее время используется для получения данных мозга мыши, но она применима и к другим органам, другим видам.