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Primer Capture Estensione: Recupero sequenza mirata da fonti DNA fortemente degradate
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September 03, 2009
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Vi presentiamo un metodo di recupero mirato antica sequenza di DNA, che abbiamo usato per ricostruire il genoma mitocondriale completo di cinque individui Neandertal. Confronto di queste sequenze con gli esseri umani oggi suggerisce che i Neanderthal avevano un lungo periodo bassa dimensione effettiva della popolazione.
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Targeted DNA Sequence RetrievalHeavily Degraded DNA SourcesMicrobial DNA ContaminationAncient BonesSample Destruction ReductionSequencing Demands ReductionDirect PCRShotgun SequencingComplete Mitochondrial DNA (mtDNA) GenomesNeandertalsGeographic RangeMtDNA Genetic DiversityLate NeandertalsContemporary Modern HumansEffective Population Size
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Briggs, A. W., Good, J. M., Green, R. E., Krause, J., Maricic, T., Stenzel, U., Pääbo, S. Primer Extension Capture: Targeted Sequence Retrieval from Heavily Degraded DNA Sources. J. Vis. Exp. (31), e1573, doi:10.3791/1573 (2009).
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