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Detection of Homologous Recombination Intermediates via Proximity Ligation and Quantitative PCR in Saccharomyces cerevisiae
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Détection d’intermédiaires de recombinaison homologues par ligature de proximité et PCR quantitative chez Saccharomyces cerevisiae

DOI:
10.3791/64240-v

•

07:55 min

•

September 11, 2022

•

, , ,
1Department of Microbiology & Molecular Genetics,University of California, Davis, 2Laboratory of Biology & Modeling of the Cell,École Normale Supérieure de Lyon, 3Department of Molecular & Cellular Biology,University of California, Davis

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:50DLC Assay
  • 01:54Cell Spheroplasting, Lysis, and Restriction Site Restoration
  • 03:19Restriction Enzyme Digest and Intramolecular Ligation
  • 05:15Results: DLC and DLE Assay Analysis of D-Loops After DSB Induction
  • 07:02Conclusion

Summary

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Les tests de capture de la boucle D (DLC) et d’extension de la boucle D (DLE) utilisent le principe de la ligature de proximité ainsi que la PCR quantitative pour quantifier la formation de la boucle D, l’extension de la boucle D et la formation de produits sur le site d’une rupture double brin inductible chez Saccharomyces cerevisiae.

Tags

Homologous RecombinationD-loopProximity LigationQuantitative PCRSaccharomyces CerevisiaeBRCA2Bloom SyndromeWerner SyndromeUV Cross-linkingSpheroplastingRestriction Enzyme Buffer

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