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環境DNA応用に関する種特異的定量PCRアッセイの開発と試験
JoVE 杂志
环境科学
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JoVE 杂志 环境科学
Development and Testing of Species-specific Quantitative PCR Assays for Environmental DNA Applications
DOI:

08:54 min

November 05, 2020

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:18Generation of a Sequence Database of Mitochondrial DNA Sequences from Target and Non-target Species of Interest
  • 02:03Assay Design
  • 03:56Assay Screening and Optimization
  • 06:21Results: A. ligamentina qPCR Assay
  • 08:23Conclusion

Summary

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環境DNAアッセイでは、現場データの収集を開始する前に、厳格な設計、テスト、最適化、検証が必要です。ここでは、環境試料から標的種DNAの検出と定量を行うための、種特異的なプローブベースのqPCRアッセイを設計する各ステップを通じてユーザーを取るプロトコルを提示する。

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