Infektion af neonatal mus med bioluminescerende E. coli O1:K1:H7 resulterer i en septisk infektion med betydelig lungebetændelse og lungepatologi. Her beskriver vi procedurer til model og yderligere undersøgelse neonatal sepsis ved hjælp af langsgående intravital billeddannelse parallelt med optælling af systemiske bakterielle byrder, inflammatorisk profilering, og lunge histopatologi.