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Journal
/
遗传学
/
代谢通路信息 GWAS 分析的路径关联研究工具
JoVE 杂志
遗传学
This content is Free Access.
JoVE 杂志
遗传学
A Pathway Association Study Tool for GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
Please note that all translations are automatically generated.
Click here for the English version.
代谢通路信息 GWAS 分析的路径关联研究工具
DOI:
10.3791/61268-v
•
05:01 min
•
July 01, 2020
•
Adam Thrash
,
Marilyn L Warburton
1
Institute for Genomics, Biocomputing & Biotechnology
,
Mississippi State University
,
2
Corn Host Plant Resistance Research Unit
,
USDA-ARS
Chapters
00:05
Introduction
00:32
Genome-Wide Association Study (GWAS) Data Loading
00:57
Load Linkage Disequilibrium (LD) Data Loading
01:26
Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Assignment
01:56
Significant Pathway Discovery
02:35
Rugplot Visualization
03:21
Results: Representative GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
04:21
Conclusion
Summary
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通过运行路径关联研究工具 (PAST),无论是通过闪亮应用还是通过 R 控制台,研究人员可以通过调查所涉及的代谢途径,更深入地了解其全基因组关联研究 (GWAS) 结果的生物学意义。
Tags
GWAS
Genome-wide Association Analysis
Metabolic Pathway
PAST
Pathway Association Study Tool
SNPs
Linkage Disequilibrium
Gene Annotation
Pathway Analysis
Rug Plots
R Console
Shiny
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