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멀티 록스 PCR 및 모세관 전기 영동에 의한 어류 병원성 박테리아 Yersinia ruckeri의 다중 궤적 가변 수 탠덤 반복 분석
JoVE 杂志
遗传学
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JoVE 杂志 遗传学
Multi-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis of the Fish-pathogenic Bacterium Yersinia ruckeri by Multiplex PCR and Capillary Electrophoresis
DOI:

10:33 min

June 17, 2019

, ,

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:53Bacterial Cultivation and Extraction of Genomic DNA
  • 01:54Multiplex PCR Setup and Cycling Conditions
  • 03:14PCR Amplicon Confirmation by Gel Electrophoresis
  • 04:37Capillary Electrophoresis Setup and Run Conditions
  • 06:06VNTR (Variable-number Tandem-repeat) Size Calling, Repeat Count Calculation and MLVA (Multi-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis) Profiling
  • 07:36Minimum Spanning Tree Cluster Analysis of MLVA Data
  • 09:21Results: Gel Electrophoresis, Electropherograms, and Minimum Spanning Tree
  • 10:09Conclusion

Summary

自动翻译

여기에 제시된 다중 궤적 가변 수 탠덤 반복 분석(MLVA) 분석은 어류 병원성 박테리아 Yersinia ruckeri의저렴하고 견고하며 휴대용 고해상도 유전자 형질 분석이 가능합니다. 순수 한 배양에서 시작, 분석 은 다운 스트림 응용 프로그램에 대한 10 층 MLVA 프로파일을 생산하기 위해 멀티 플렉스 PCR 및 모세관 전기 영동을 사용합니다.

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