Journal
/
生物化学
/
Bereiding van de monsters voor de massa spectrometrie gebaseerde identificatie van RNA-bindende regio 's
JoVE 杂志
生物化学
需要订阅 JoVE 才能查看此.  登录或开始免费试用。
JoVE 杂志 生物化学
Sample Preparation for Mass Spectrometry-based Identification of RNA-binding Regions
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Bereiding van de monsters voor de massa spectrometrie gebaseerde identificatie van RNA-bindende regio 's

DOI:
10.3791/56004-v

•

10:52 min

•

September 28, 2017

•

, , , ,
1Epigenetics Institute,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine, 2Department of Cell and Developmental Biology,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine, 3Department of Biochemistry and Biophysics,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine, 4Graduate Group in Biochemistry and Biophysics,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:04Crosslink of Protein-RNA Interactions in Live Cells
  • 03:26Isolation of Nuclei
  • 04:27Lysis of Nuclei and Trypsin Digestion
  • 05:51Desalting of Peptides
  • 07:39Removal of Crosslinked RNA
  • 08:44Results: RNA-binding Protein and RNA-binding Region Identification
  • 10:04Conclusion

Summary

自动翻译

自动翻译

We beschrijven een protocol te identificeren van RNA-bindende proteïnen en kaart van de regio's hun RNA-bindende in levende cellen met behulp van UV-gemedieerde photocrosslinking en massaspectrometrie.

Tags

Keywords: Sample PreparationMass SpectrometryRNA-binding ProteinsUV Cross-linking4sU LabelingCell FractionationImmunoprecipitationProtein-RNA InteractionsEpigeneticsCell CultureMouse Embryonic Stem Cells

Article

Embed

添加到播放列表

Usage Statistics

Related Videos

check_url/cn/56004?article_type=v

Een vloeistofchromatografie tandem-massaspectrometrie gebaseerde benadering voor metabolietanalyse van<em> Staphylococcus aureus</em
check_url/cn/56004?article_type=v

Vastleggen en identificatie van RNA-bindende proteïnen met behulp van klik chemie-bijgewoonde RNA-interactome vangen (CARIC) strategie
check_url/cn/56004?article_type=v

Identificatie van functionele eiwit regio's via chimeer eiwit bouw
check_url/cn/56004?article_type=v

Nitropeptide profilering en identificatie geïllustreerd door angiotensine II
check_url/cn/56004?article_type=v

Een plasmamonstervoorbereiding voor massaspectrometrie met behulp van een geautomatiseerd werkstation
check_url/cn/56004?article_type=v

Monster voorbereiding voor Probe Electrospray Ionization Mass Spectrometry
check_url/cn/56004?article_type=v

Ongerichte vloeibare chromatografie-massaspectrometrie-gebaseerde metabolomics analyse van tarwekorrel
check_url/cn/56004?article_type=v

TMT Sample Voorbereiding voor Proteomics Facility Indiening en latere data-analyse
check_url/cn/56004?article_type=v

Een op massaspectrometrie gebaseerde proteomics-benadering voor wereldwijde en betrouwbare eiwit-R-methylatieanalyse
check_url/cn/56004?article_type=v

Voorbereiding van hoge temperatuur monsterroosters voor Cryo-EM

Read Article