Summary

RGBradford: Cuantificación de proteínas con la cámara de un teléfono inteligente

Published: September 08, 2023
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Summary

Este artículo proporciona un protocolo para la cuantificación de proteínas utilizando el ensayo Bradford y un teléfono inteligente como dispositivo analítico. Los niveles de proteínas en las muestras se pueden cuantificar utilizando datos de color extraídos de una imagen de una microplaca tomada con un teléfono inteligente.

Abstract

La cuantificación de proteínas es un procedimiento esencial en la investigación en ciencias de la vida. Entre otros métodos, el ensayo de Bradford es uno de los más utilizados. Debido a su amplia difusión, se han informado exhaustivamente las limitaciones y ventajas del ensayo de Bradford, incluyendo varias modificaciones del método original para mejorar su rendimiento. Una de las alteraciones del método original es el uso de la cámara de un teléfono inteligente como instrumento analítico. Aprovechando las tres formas del colorante Coomassie Brilliant Blue que existen en las condiciones del ensayo de Bradford, este artículo describe cómo cuantificar con precisión la proteína en muestras utilizando datos de color extraídos de una sola imagen de una microplaca. Después de realizar el ensayo en una microplaca, se toma una imagen con la cámara de un teléfono inteligente y se extraen datos de color RGB de la imagen utilizando una aplicación de software de análisis de imágenes gratuita y de código abierto. A continuación, se utiliza la relación entre la intensidad azul y verde (en la escala RGB) de muestras con concentraciones desconocidas de proteína para calcular el contenido de proteína en función de una curva estándar. No se observan diferencias significativas entre los valores calculados utilizando datos de color RGB y los calculados utilizando datos de absorbancia convencionales.

Introduction

Independientemente del uso posterior (por ejemplo, ELISA, cinética enzimática, Western blot, purificación de proteínas y espectrometría de masas), la cuantificación de proteínas es crucial para un análisis preciso en los laboratorios de ciencias de la vida. Además de su uso como lecturas secundarias (es decir, para calcular los niveles relativos de analitos por masa de proteína), los niveles de proteína en una muestra también pueden ser el resultado deseado en sí mismo. Por ejemplo, uno puede estar interesado en los niveles de proteínas en los recursos alimenticios1 o en la orina2. Hay muchos métodos disponibles para medir la concentración de proteínas en las muestras3, incluidas las lecturas directas de absorbancia UV4, la quelación proteína-cobre 5,6, los ensayos colorimétricos de unión proteína-colorante7 y los ensayos fluorescentes de unión proteína-colorante8. La relevancia de la cuantificación de proteínas se evidencia por la presencia de dos artículos que describen métodos de medición de proteínas 5,7 en el top-3 de la literatura más citada 9,10. A pesar del hecho de que muchos autores descuidan su cita real citando referencias no primarias o no citando nada en absoluto, los artículos originales que describen el ensayo de proteína de Lowry y el ensayo de proteína de Bradford suman >200,000 citas cada10.

La popularidad del ensayo Bradford se debe a su asequibilidad, simplicidad, velocidad y sensibilidad. El ensayo se basa en la interacción entre las proteínas y el colorante Coomassie Brilliant Blue G en condiciones ácidas. En las condiciones del ensayo (es decir, pH bajo), el colorante existe en tres formas: una forma catiónica roja con λmax a 470 nm; una forma neutra verde con λmax a 650 nm; y una forma aniónica azul con λmax a 590 nm11,12 (Figura 1). La forma catiónica predomina en ausencia de proteínas. A medida que las proteínas interactúan con el colorante, estabilizan la forma aniónica azul, lo que provoca un cambio notable en el color de la solución, de marrón a azul. Por lo general, el cambio en la concentración de la forma azul del colorante se cuantifica espectrofotométricamente, cuya absorbancia a 590-595 nm es proporcional a la cantidad de proteína en el ensayo.

Figure 1
Figura 1: Espectros de absorción G azul brillante de Coomassie bajo las condiciones del ensayo Bradford. Los tres picos principales están marcados con flechas que indican el λmax de las formas roja (470 nm), verde (650 nm) y azul (590 nm) del tinte. Los espectros se registraron en ausencia de proteína (línea amarilla) y en presencia de 3 μg (línea gris) y 10 μg (línea azul) de albúmina sérica bovina. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

El uso generalizado del ensayo de Bradford ha llevado a la identificación de varias limitaciones (p. ej., respuestas variables a diferentes proteínas11 e interferencia de lípidos13 y detergentes7) y al desarrollo de modificaciones para mejorar su rendimiento (p. ej., la adición de detergentes 14,15, alcalinización14,16 y el uso de la relación de absorbancias17). Además de las modificaciones en el propio ensayo, también se ha descrito el uso de dispositivos alternativos, como teléfonos inteligentes o cámaras, para capturar señales analíticas 18,19,20. De hecho, el desarrollo de métodos que hacen uso de teléfonos inteligentes como analizadores químicos portátiles ha sido un área activa de investigación. La motivación para el uso de teléfonos inteligentes se deriva de la asequibilidad, portabilidad, facilidad de uso y amplia disponibilidad de estos dispositivos.

Este artículo proporciona un protocolo para la cuantificación de proteínas utilizando el ensayo RGBradford20, que utiliza un teléfono inteligente como dispositivo analítico. A diferencia de la publicación original de RGBradford20, aquí se ha introducido un procedimiento que agiliza el proceso de extracción de color. Implica la utilización de una aplicación de software disponible gratuitamente para extraer automáticamente la información de color de cada pocillo de una imagen de microplaca, lo que ahorra mucho tiempo y esfuerzo. Esta es una alternativa al método anterior de adquirir manualmente los datos de color de cada pocillo uno por uno utilizando una aplicación de software de edición de gráficos20. En última instancia, los niveles de proteínas en las muestras se pueden cuantificar utilizando datos de color extraídos de una imagen de una microplaca tomada con un teléfono inteligente.

Protocol

1. Preparación del reactivo de ensayo de proteínas Bradford Disolver 100 mg de Coomassie Brilliant Blue G en 50 ml de etanol al 95% (p/v). Mezclar hasta que Coomassie Brilliant Blue G se disuelva por completo.PRECAUCIÓN: El etanol es inflamable y causa irritación en los ojos. Evite las llamas y use gafas. A la solución anterior, agregue 100 ml de ácido fosfórico al 85% (p/v) con cuidado.PRECAUCIÓN: El ácido fosfórico es corrosivo para los metales y causa corrosión e…

Representative Results

La Figura 4 es una imagen de una microplaca de la que se extrajeron datos de color y se registró la absorbancia a 450 nm y 590 nm. Los datos de color RGB reportados aquí como representativos se obtuvieron automáticamente como se describe en la sección 5. Un patrón típico de datos de color es un aumento en los valores de azul y una disminución en los valores de rojo y verde (Figura 5). Tenga en cuenta que, a pesar de la reflexión evidente en todos los poc…

Discussion

Este artículo describe RGBradford, un método que utiliza la cámara de un teléfono inteligente para registrar datos de un ensayo de proteína de Bradford, extraer datos de color y cuantificar con precisión los niveles de proteína en muestras biológicas, como se describióoriginalmente recientemente. Una diferencia con el método RGBradford original es que aquí se utilizó un procedimiento para obtener datos de color automáticamente con un complemento ImageJ22 . La p…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Este trabajo fue financiado por el Consejo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (CNPq, Brasil) [números de beca 428048/2018-8 y 402556/2022-4] y la Universidad de Brasilia (Brasil). El autor agradece al Dr. Duarte Nuno Carvalho y a la Dra. Evelyn Santos (i3s, Oporto, Portugal) por proporcionar acceso a sus teléfonos inteligentes utilizados en esta investigación.

Materials

96-well flat-bottom polystyrene microtiter plates  Jet Biofil, Guangzhou, China TCP011096 Any flat-bottom microplate compativle with optical reading will suffice. 
Bovine serum albumin Sigma-Aldrich, St. Louis, MO A2153
Coomassie Brilliant Blue G Sigma-Aldrich, St. Louis, MO B0770
Ethyl alcohol
iPhone 11 Apple MWM02BR/A Can be substituted with other smartphone equiped with a camera
iPhone 14 Pro Apple N/A
Phosphoric acid Sigma-Aldrich, St. Louis, MO 695017
Redmi Note 9 Pro XIAOMI  N/A
S22 Ultra Samsung  N/A
SpectraMax 384 Plus. Microplate reader. Molecular Devices, San Jose, CA PLUS 384 Any microplate reader capable of reading at 450 nm and 590 nm will work. This is optional. The method was actually created to dismiss the need of a microplate reader.

References

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Cite This Article
Moreira, D. C. RGBradford: Protein Quantitation with a Smartphone Camera. J. Vis. Exp. (199), e65547, doi:10.3791/65547 (2023).

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