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TACI: Un plugin de ImageJ para el análisis de imágenes de calcio 3D
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TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis
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TACI: Un plugin de ImageJ para el análisis de imágenes de calcio 3D

español

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09:39 min

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December 16, 2022

DOI:

10.3791/64953-v

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10.3791/64953-v

•

09:39 min
December 16, 2022

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1School of Neuroscience,Virginia Polytechnic Institute and State University, 2CMU-Pitt Joint Computational Biology, School of Medicine,University of Pittsburgh, 3Eastern Virginia Medical School, 4Department of Physics,University of Miami

Summary

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TrackMate Analysis of Calcium Imaging (TACI) es un complemento de código abierto de ImageJ para el análisis de imágenes de calcio en 3D que examina el movimiento en el eje z e identifica el valor máximo de cada pila z para representar la intensidad de una celda en el punto de tiempo correspondiente. Puede separar neuronas que se superponen en la dirección lateral (x / y) pero en diferentes planos z.

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3D Calcium ImagingImageJ PluginTACIMotion CorrectionZ-driftTemperature RecordingPeltierTIFF File RenamingTIFF File Organizing

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Omelchenko, A. A., Bai, H., Hussain, S., Tyrrell, J. J., Klein, M., Ni, L. TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis. J. Vis. Exp. (190), e64953, doi:10.3791/64953 (2022).

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