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Modelagem da estrutura quaternária através da espectrometria de massa transversal química: estendendo os relatórios de Jupyter TX-MS
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October 20, 2021
DOI:
1Equipe Signalisation Calcique et Infections Microbiennes,Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, 2Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, 3Scientific IT Services,ETH Zurich, 4Institute for Computational Science,University of Zurich, 5S3IT,University of Zurich, 6Division of Infection Medicine, Department of Clinical Sciences Lund, Faculty of Medicine,Lund University
Summary
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Espectrometria de massa cruzada direcionada cria modelos de estrutura de proteína quaternária usando dados de espectrometria de massa adquiridos usando até três protocolos de aquisição diferentes. Quando executados como um fluxo de trabalho simplificado no servidor web Cheetah-MS, os resultados são relatados em um Notebook Jupyter. Aqui, demonstramos os aspectos técnicos de como o Caderno Jupyter pode ser estendido para uma análise mais aprofundada.
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Khakzad, H., Vermeul, S., Malmström, L. Quaternary Structure Modeling Through Chemical Cross-Linking Mass Spectrometry: Extending TX-MS Jupyter Reports. J. Vis. Exp. (176), e60311, doi:10.3791/60311 (2021).
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