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Una pipeline completa per l'isolamento e la sequenza dei microRNA e la loro analisi tramite gli strumenti open source
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A Complete Pipeline for Isolating and Sequencing MicroRNAs, and Analyzing Them Using Open Source Tools
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Una pipeline completa per l'isolamento e la sequenza dei microRNA e la loro analisi tramite gli strumenti open source

italiano

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00:09 min

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August 21, 2019

DOI:

10.3791/59901-v

DOI:
10.3791/59901-v

•

00:09 min
August 21, 2019

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, ,
1Division of Medical Genetics,University of Washington School of Medicine

Summary

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In questo articolo viene descritta una strategia dettagliata per l'isolamento di piccoli RNA, l'arricchimento dei microRNA e la preparazione di campioni per il sequenziamento ad alto valore di velocità effettiva. Viene quindi descritto come elaborare le letture di sequenza e allinearle ai microRNA, utilizzando strumenti open source.

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Course, M. M., Gudsnuk, K., Valdmanis, P. N. A Complete Pipeline for Isolating and Sequencing MicroRNAs, and Analyzing Them Using Open Source Tools. J. Vis. Exp. (150), e59901, doi:10.3791/59901 (2019).

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