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ExCYT: Eine grafische Benutzeroberfläche für die Straffung der Analyse hochdimensionaler Cytometry Daten
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11,147 Views
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05:12 min
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January 16, 2019
DOI:
1The Bloomberg~Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy,Johns Hopkins University School of Medicine, 2The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center,Johns Hopkins University School of Medicine, 3Department of Biomedical Engineering,Johns Hopkins University School of Medicine, 4Department of Immunology,Johns Hopkins University School of Medicine, 5Department of Pathology,Johns Hopkins University School of Medicine
Summary
Automatically generated
ExCYT ist ein MATLAB-basierte grafische Benutzeroberfläche (GUI), die Benutzern erlaubt, ihre Flow Cytometry über häufig Datenanalyse Analysetechniken für hochdimensionale Daten, einschließlich der Reduzierung der Dimensionalität über t-SNE, eine Vielzahl von automatisierten und manuellen beschäftigt Clustering-Methoden, Heatmaps und neuartige hochdimensionalen Fluss Grundstücke.
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Sidhom, J., Theodros, D., Murter, B., Zarif, J. C., Ganguly, S., Pardoll, D. M., Baras, A. ExCYT: A Graphical User Interface for Streamlining Analysis of High-Dimensional Cytometry Data. J. Vis. Exp. (143), e57473, doi:10.3791/57473 (2019).
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