Journal
/
Biology
/
Associated Chromosoom Trap voor het vaststellen van lange afstand DNA-interacties
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
Associated Chromosome Trap for Identifying Long-range DNA Interactions
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Associated Chromosoom Trap voor het vaststellen van lange afstand DNA-interacties

DOI:
10.3791/2621-v

•

14:49 min

•

April 23, 2011

•

,
1Medical Service, VA Palo Alto Health Care System ,Stanford University School of Medicine

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:30Formaldehyde Fixation of Long-Range Chromatin Interactions and Nuclei Isolation
  • 03:36Digestion, Ligation and Purification of Interaction DNA Segments
  • 06:10Digestion with Msp I and Ligation with Oligonucleotide Linkers
  • 07:50PCR Amplification and Sequence Analysis
  • 11:06Act Assay Representative Results
  • 14:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

De bijbehorende chromosoom val (ACT) assay is een nieuwe onpartijdige methode voor het identificeren van lange-afstands-DNA interacties. De karakterisering van de lange reeks DNA-interacties zal ons toelaten om de relatie van de nucleaire architectuur vast te stellen om genexpressie in zowel de normale fysiologie en in zieke staten.

Tags

Associated Chromosome TrapLong-range DNA InteractionsChromatin StructureChromosome TerritoriesGene ExpressionTranscriptional FactoriesCo-localizationACT AssayChromosome Conformation Capture TechniqueTranscriptional RegulationNuclear ArchitectureGene Expression In Disease States

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Split-Ubiquitine membraanfilters op Yeast Two-Hybrid (mythe) Systeem: een krachtig hulpmiddel voor het identificeren van eiwit-eiwit interacties

De voorbereiding van Drosophila polytheen Chromosoom Pompoenen voor antilichaam Labeling

Het meten van de buigstijfheid van de bacteriële cellen Met behulp van een optische val

Een TL-screeningstest voor het vaststellen van Modulators van GIRK kanalen

De combinatie van Single-molecule Manipulatie en Imaging voor de Studie van eiwit-DNA interacties

Real-time beeldvorming van Single Engineered RNA-transcripten in levende cellen door gebruik Ratiometrische Bimoleculaire Beacons

Gecombineerde DNA-RNA-TL<em> In situ</em> Hybridisatie (FISH) aan X-chromosoom inactivatie studeren in Gedifferentieerde vrouwelijke muis embryonale stamcellen

Chromatine immunoprecipitatie assay voor de identificatie van Arabidopsis eiwit-DNA interacties<em> In Vivo</em

Damid-seq: Genoom-brede kaart brengen van eiwit-DNA-interacties door High Throughput Sequencing van adenine gemethyleerd DNA-fragmenten

Versterking, next-generation sequencing en Genomic DNA in kaart brengen van retrovirale integratie Sites

Read Article