我们提出了有针对性的古DNA序列检索,这是我们用来重建完整的线粒体基因组的5个尼安德特人的个人方法。现今人类的这些序列的比较表明,尼安德特人有一个长期的低有效的人口规模。
我们提出了有针对性的DNA DNA的来源,其中严重退化和污染的微生物DNA序列检索的方法,是典型的古代骨骼。该方法大大降低了样品的破坏和测序的要求相对于直接PCR或鸟枪测序方法。我们用这种方法来重建完整的线粒体DNA(mtDNA)的五个尼安德特人的基因组,来自全国各地其地理范围。后期尼安德特人线粒体DNA的遗传多样性比当代现代人类的大约三倍。连同线粒体蛋白质进化分析,这些数据表明,尼安德特人的长期有效的人口规模小于现代人类和现存的类人猿。
佩奇方法简单,快速,敏感性和特异性。因此,我们设想的作者的多个应用程序古代DNA外,如捕获的小分子RNA的RNA库的片段,审讯在样本或捕获16S(或其他位点)的多样性从宏基因组样品的结构变化。有一点要提的是,捕获灵敏度的PEC引物的多重捕获反应增加。因此,PEC是不是非常适合非常大(例如megabase或以上)的捕捉区域捕捉,但捕捉小目标的地区,许多人在快速时尚甚至SNP的立场是非常适合。
The authors have nothing to disclose.
我们感谢M.迈尔的意见;克罗地亚科学和艺术学院和柏林 – 勃兰登堡科学院后勤和科学支持科学和马普学会主席创新基金的财政支持。 JMG是支持由美国国家科学基金会国际博士后奖学金(OISE – 0754461)。序列是存放在EBI的核苷酸数据库加入数字:1(Feldhofer 1)穴居人FM865407,尼安德特人2(Feldhofer 2)FM865408,Sidron 1253 FM865409,Vindija 33.25 FM865410,Mezmaiskaya 1 FM865411