Campylobacter spp.의 검출 및 분리 날고기
Summary
캄필로박터는 전 세계적으로 세균성 식인성 위장염의 주요 원인입니다. 시설에서 시설 전체의 유병률을 줄이기 위한 조치를 취하고 있음에도 불구하고 오염된 제품은 지속적으로 소비자에게 도달합니다. 지난 12년 동안 개발된 이 기술은 날고기에서 캄필로박터 종(Campylobacter spp.)을 분리하고 검출하는 기존 방법의 한계를 해결합니다.
Abstract
이 논문은 날고기에서 캄필로박터 종(Campylobacter spp.)을 분리하기 위한 신속하면서도 강력한 프로토콜을 제시하며, 특히 캄필로박터 제주니(Campylobacter jejuni )와 캄필로박터 대장균(Campylobacter coli)에 초점을 맞춥니다. 이 프로토콜은 확립된 방법을 기반으로 하며, 미국의 FDA(Food and Drug Administration) 및 미국 농무부(USDA)와 유럽의 ISO(International Organization for Standardization)와 같은 규제 기관에서 사용하는 일반적인 기술과의 호환성을 보장합니다. 이 프로토콜의 핵심은 말의 피를 함유한 볼튼 브로스 배지에 농축 및 재현탁되는 린세이트를 수집하는 것입니다. 이 배지는 스트레스를 받는 캄필로박터 세포의 회복을 촉진하고 필요한 농축 기간을 50% 줄이는 것으로 입증되었습니다. 그런 다음 농축된 샘플은 브루셀라 플레이트의 니트로셀룰로오스 막으로 옮겨집니다. 이 방법의 감도와 특이성을 개선하기 위해 0.45μm 및 0.65μm 공극 크기의 필터 멤브레인을 평가했습니다. 데이터에 따르면 특이성에 영향을 주지 않고 0.45μm 기공 크기에 비해 0.65μm 기공 크기 필터를 사용한 경우 세포 회수율이 29배 증가한 것으로 나타났습니다. 캄필로박터 의 높은 운동성 특성으로 인해 세포가 멤브레인 필터를 통해 한천 배지를 향해 활발하게 이동할 수 있으며, 이를 통해 순수한 캄필로박터 콜로니를 효과적으로 분리할 수 있습니다. 이 프로토콜은 종 수준에서 분리체를 식별하기 위해 다중 정량적 실시간 중합효소 연쇄 반응(mqPCR) 분석을 통합합니다. 이 분자 기술은 신뢰할 수 있고 효율적인 종 식별 수단을 제공합니다. 지난 12년 동안 소매 육류와 관련하여 수행된 조사는 이 방법이 현재의 참조 방법과 비교하여 자연적으로 오염된 육류 샘플에서 캄필로박터 의 회수율을 높일 수 있는 능력을 입증했습니다. 또한 이 프로토콜은 준비 및 처리 시간 단축을 자랑합니다. 결과적으로, 육류에서 캄필로박터를 효율적으로 회수할 수 있는 유망한 대안을 제시합니다. 또한 이 절차는 DNA 기반 방법과 원활하게 통합될 수 있어 포괄적인 전체 게놈 염기서열 분석과 함께 양성 샘플의 신속한 스크리닝을 용이하게 합니다.
Introduction
캄필로박터 종(Campylobacter spp.)은 전 세계적으로 세균성 식인성 위장염의 주요 원인으로, 매년 약 8억 명의 환자가 발생하는 것으로 추정됩니다1. 주요 인수공통감염병인 캄필로박터는 야생조류, 농장동물, 애완동물 등 다양한 동물의 위장관에 자연적으로 서식한다2. 도축 또는 식품 가공 과정에서 캄필로박터 종은 종종 사체나 육류 제품을 오염시킵니다3. 캄필로박터증은 일반적으로 덜 익힌 가금류의 섭취 또는 생가금류즙에 의한 다른 식품의 교차 오염과 관련이 있다2. 길랭-바레 증후군(Guillain-Barré syndrome), 반응성 관절염(reactive arthris), 패혈증(septicemia)과 같은 심각한 합병증을 유발할 수 있다4. 식품 공급원, 특히 가금류 제품에서 캄필로박터를 검출하고 분리하는 것은 공중 보건 감시, 발병 조사 및 위험 평가에 필수적입니다.
종래의 배양 기반 분석법은 캄필로박터 검출을 위한 전통적이고 표준적인 방법이다 5,6. 그러나 긴 배양 시간(48시간 이상), 낮은 민감도(최대 50%), 모든 균주에 국한되지 않는 등 몇 가지 제한 사항이 있습니다(일부 스트레스를 받는 캄필로박터 세포는 배지에서 잘 자라지 않거나 전혀 자라지 않을 수 있음)7. 중합효소연쇄반응(PCR)과 같은 분자 분석법은 배양 기반 방법보다 더 빠르고 민감하지만 추가 특성 분석을 위한 실행 가능한 분리물을 제공하지 않습니다 8,9.
면역학적 방법은 캄필로박터 검출을 위한 대체 및 보완 방법입니다. 이는 빠르고 간단하며 다재다능하지만 교차 반응(일부 항체는 비캄필로박터 박테리아 또는 유사한 항원을 공유하는 기타 물질에 결합할 수 있음), 낮은 특이성(일부 항체는 모든 캄필로박터 균주 또는 혈청형에 결합하지 않을 수 있음) 및 검체 전처리 요구 사항(면역학적 방법은 항체의 결합을 향상시키기 위해 간섭 물질을 제거하기 위해 검체의 전처리가 필요한 경우가 많음)을 비롯한 몇 가지 제한 사항도 있습니다.10을 클릭합니다.
캄필로박터균 속(genus of Campylobacter) 내에서 C. jejuni와 C. coli는 대부분의 인간 캄필로박터 감염을 일으킵니다(각각 81% 및 8.4%)11. 둘 다 단극 편모 또는 양극성 편모를 포함하는 나선형 모양의 미세 호기성 및 호열성 박테리아입니다. 각 극에서 편모의 회전은 특징적인 코르크 마개 운동성의 주요 원동력이자 박테리아가 숙주 위장관의 점막 점막을 통해 헤엄칠 수 있도록 하기 때문에 발병에 결정적인 것으로 간주됩니다. 캄필로박터균의 운동성은 세포가 유리한 환경으로 이동할 수 있도록 하는 화학감각 시스템에 의해 조절된다12,13. 캄필로박터균의 세포 형태 및 생리학적 특성에 기초하여, 몇몇 연구에서는 분변 및 환경 시료로부터 캄필로박터 종(Campylobacter spp.)을 분리하기 위해 막 여과를 활용하였다 14,15,16.
이 연구는 날고기에서 C. jejuni 및 C. coli 의 분리 및 후속 검출을 위한 빠르고 강력한 프로토콜을 제시하여 기존 방법의 단점을 극복하고 몇 가지 이점을 제공합니다. 잠정 콜로니는 현미경, 생화학적 검사(예: 카탈라아제 및 산화효소 활성 분석) 또는 분자 분석과 같은 다양한 방법을 사용하여 캄필로박터 종으로 확인할 수 있다6. 이 방법은 C. jejuni 및 C. coli 에 고유한 유전자를 표적으로 하는 multiplex real-time PCR(mqPCR) 분석을 사용하여 종 수준에서 분리물을 식별합니다. 이 방법은 비교적 저렴하고 빠르며 선택적이므로 식품 가공 시설, 임상 실험실 및 연구 실험실을 포함한 다양한 환경에서 사용하기에 적합합니다.
Protocol
Representative Results
Discussion
프로토콜의 중요성
C. jejuni와 C. coli는 가금류22 및 동물 간 23,24에서 널리 퍼져 있는 것으로 밝혀진 캄필로박터의 두 가지 주요 종이었다. 이 연구에서는 닭 부위(다리, 날개, 허벅지), 닭 간 및 소 간의 육류 샘플을 캄필로박터 종(Campylobacter spp)의 분리를 위해 서로 다른 기간 동안 다른 소매점 및 제조업체에서 무작위로 수집했습니다. 분리된 총 49종의 캄필로박터 균주 중 36종은 C. jejuni, 13종은 대장균으로 확인되었으며, 다른 캄필로박터 종은 발견되지 않았으며, 이는 다른 보고와 일치한다25.
이 분석은 Campylobacter spp.의 나선형 세포 형태와 특징적인 코르크 마개 모양의 운동성을 기반으로 합니다. 나선형 세포 형태 (길고 가느다란 0.2-0.9 x 0.5-5 μm)와 강한 코르크 마개 운동성을 이용한 간단하지만 효과적인 수동 여과 기술26,27을 사용하여 배경 유기체의 혼합물로부터 캄필로박터를 분리했습니다. 캄필로박터의 높은 운동성은 세포가 멤브레인 필터를 통과하여 한천 배지 내에서 발견되는 유리한 조건으로 이동할 수 있도록 하는 반면, 육류 제품의 다른 배경 미생물은 통과할 수 없었습니다. 이 방법은 비교적 저렴하고 빠르며 선택적이므로 식품 가공 시설, 임상 실험실 및 연구 실험실을 포함한 다양한 환경에서 사용하기에 적합합니다.
자주 인용되는 선구적인 논문에 따르면 0.45μm 필터가 너무 잘 작동하여 0.65μm는 평가되지 않았다고 합니다28. 본 연구의 결과는 0.65μm 공극 크기 필터가 0.45μm 공극 크기보다 훨씬 더 나은 성능을 발휘하여 농축에서 회수된 세포 수가 29배 증가했음을 나타냅니다. 이는 선택된 필터들이 이전에 보고된 바와 같이 감소된 선택성을 나타내지 않기 때문에 중요하다29. 또한, 여과는 직접 도금(30)에 비해 회수된 캄필로박터의 양을 현저히 감소시키는 것으로 알려져 있으며, 따라서 기공의 크기를 증가시키는 것은 미생물의 회복을 향상시키며, 이는 이전에 보고된 결과와 일치한다(21). 이는 필터를 통과하는 모든 세포가 균일한 캄필로박터 군집을 형성했기 때문에 중요하며, 이는 두 필터 모두 다른 미생물 및 식품 입자가 통과하는 것을 방지하기에 충분함을 나타냅니다. 또한 FSIS 흐름도7은 항생제가 포함된 Campy-Cefex 플레이트의 재줄무늬 분리로 인해 결과 생산이 연장될 수 있는 가능성에 주목합니다. 대조적으로, 이 원고에 설명된 프로토콜은 여과 및 선택적 농축의 사용을 세포페라존, 사이클로헥시미드, 트리메토프림 및 반코마이신과 결합하며, 재-스트리킹을 필요로 하지 않습니다.
현재 사용되는 방법은 현재 FSIS 샘플링 및 검증 프로그램17과 일치합니다. 캄필로박터 오염 수준이 낮을 수 있으므로(153 CFU/450 g 닭고기) 헹굼 시 원심분리하여 샘플을 4배 농축하여 분석의 감도를 높입니다. 헹굼수를 4배 농축한 후 샘플을 48시간 동안 농축하고 분자 검출 시스템(MDS)으로 스크리닝하여 FSIS 실험실에서 사용하는 방법을 복제합니다(데이터는 표시되지 않음). 특히, 설명된 방법은 48시간의 농축을 사용하여 분자 검출 시스템에 의해 검출된 24시간 이내에 양성 균주를 식별하지 못했습니다(데이터는 표시되지 않음). 마지막으로, 이 프로토콜의 또 다른 이점은 박테리아 종과 관련된 정보를 제공하고 캄필로박터 가 C.coli, C. jejuni 또는 C. lari인지 식별할 수 있는 반면, MLG 41.07에서 채택된 MDS는 캄필로박터에 대한 이분법적 양성/음성 반응만 제공할 수 있다는 것입니다.
중요 단계
캄필로박터 분리 및 식별을 위한 프로토콜은 원심분리, 여과 및 분자 분석 중에 정밀도를 필요로 합니다. 정확한 희석, 적절한 배양 조건 및 qPCR 분석 조건에 대한 세심한 준수는 신뢰할 수 있는 종 식별에 중추적인 역할을 합니다.
미세 호기성 박테리아인 캄필로박터는 매우 연약하고 다양한 환경 스트레스에 민감하며 성장을 위해서는 독특하고 까다로운 조건이 필요합니다 31,32,33. 전형적으로 장시간의 운송 및 보관을 거치는 식품 샘플에서, 많은 캄필로박터 세포는 아마도 휴면 상태 또는 준치사/치사적 손상 상태에 있을 것이다34,35. 따라서 식품 매트릭스에서 스트레스를 받은 세포를 회수하고 더 높은 농도로 성장시키는 것이 중요합니다. 시술의 첫 번째 단계에서, 우리는 음식에서 캄필로박터를 선택적으로 농축하기 위해 호수 말의 혈액과 항생제를 보충한 Bolton Broth를 사용했습니다. 첨가 혈액은 자유 산소 라디칼36의 부작용을 극복하기 위해 산소 담금질제 역할을 했다. 항생제는 배경 미생물37의 성장을 억제하기 위해 사용되었다.
주변 대기 산소에 대한 캄필로박터 의 노출 시간을 최소화하기 위해 세포가 필터를 통과할 수 있도록 15분의 배양 기간을 선택했습니다. 또한 필터 아래의 Brucella 한천 플레이트의 수분은 통과 속도에 중요한 역할을 했습니다. 특히, 0시간, 1시간, 2시간 및 3시간 동안 건조된 한천 플레이트를 테스트한 결과는 필터의 높은 수분 함량이 세포를 통과시키는 것을 방지한다는 것을 시사했습니다. 플레이트와 필터에 필터와 방울을 정확하게 배치하는 것도 마찬가지로 중요하며, 이 두 가지 모두 세포 분리의 성공에 영향을 미칩니다.
잠재적 위험 및 한계
생닭 샘플에서 캄필로박터 종을 분리하고 식별하기 위한 구조화된 접근 방식을 제시하는 동안 이 프로토콜의 몇 가지 제한 사항에 주의를 기울일 필요가 있습니다. 외부 오염, 불충분하게 건조된 플레이트, 미생물 이동을 방해하는 필터 막힘, 펠릿 내 미생물 포집, 대기 챔버의 불완전한 밀봉, 필터 경계를 넘어 퍼지는 방울이 주요 위험 중 하나입니다.
식품 표면에서 미생물을 부적절하게 분리하거나 샘플의 벌크 내에 미생물을 가두면 이 방법을 사용하여 미생물을 분리하는 데 방해가 될 수 있습니다. 또한 패시브 필터를 통과하기 위해 미생물 운동성에 의존하는 것은 주목할 만한 한계가 있습니다. 필터막이 운동성이 다소 덜한 캄필로박터 균주를 유지했을 가능성이 있는데, 이는 필터가 식품 내 미생물 병원체의 포획 효율을 감소시킬 수 있다는 것이 나타난 바와 같다38. 추가 제한 사항에는 원심분리 및 여과 공정의 배치 특성, 필터 막힘에 대한 민감성, 형성된 펠릿 분산의 비효율성이 포함되며, 이는 미생물 부하의 정확도에 영향을 미칩니다. 이러한 한계는 특히 다양한 시료 유형을 다루거나 고처리량 기능을 추구할 때 포괄적인 분석을 보장하기 위한 주의 및 보충 방법론의 필요성을 강조합니다.
문제 해결을 위한 제안
잠재적인 문제를 미연에 방지하려면 먼저 모든 재료가 필요한 품질 표준을 준수하고 만료되지 않았는지 확인합니다. 니트로셀룰로오스 멤브레인을 통한 캄필로박터 의 통과를 제한할 수 있는 큰 오염 물질을 제거하기 위해 잠재적으로 추가 여과를 사용하여 막힌 필터 문제를 해결하십시오. 오염이 관찰되면 방울이 필터 가장자리에 너무 가깝게 배치되지 않았는지 확인하고 액체가 기공을 통과하지 않고 필터 주위를 이동하여 한천에 도달하도록 합니다. 농축 후 성장이 충분하지 않은 경우 대기 용기의 밀봉이 단단하고 누출되지 않는지 확인하십시오.
잠재적인 개선 및 확장
대체 필터 재료를 탐색하면 미생물 통과를 향상시킬 수 있으며 식품과 같은 이종 혼합물에서 다른 운동성 미생물을 분리하는 데 사용할 수 있도록 이 프로토콜을 확장할 수 있습니다. 특이성에 부정적인 영향을 미치지 않으면서 운동성이 낮은 캄필로박터 변이체를 유지하기 위한 대조군을 식별하는 것이 좋습니다. 또한 이 연구에 사용된 다중 qPCR 분석은 C.lari18 을 검출할 수 있는 능력이 있는 것으로 입증되었지만 이 분석에는 관심 있는 다른 캄필로박터 종이 포함될 수 있습니다.
요약하면, 다양한 파라미터와 설정을 평가하여 식품에서 C. jejuni 및 C. coli 의 필터 기반 분리 및 종 수준 식별을 위한 적절한 조건을 설정했습니다. 이 방법은 민감하고, 구체적이며, 강력하고, 비용 효율적인 것으로 입증되었습니다. 이 프로토콜은 이를 실제 식품 샘플에 적용하여 79개의 육류 포장에서 36 개의 C. jejuni 균주와 13개의 C. coli 균주를 분리할 수 있었습니다.
이 프로토콜은 생닭 부위 샘플링 절차를 설명하는 FSIS 지침 10,250.117과 캄필로박터의 분리 및 식별을 위한 MLG 41.076에 부합합니다. 데이터에 따르면 샘플을 4배 농축하고 여과 및 도금과 함께 24시간 동안 농축하면 96시간이 아닌 48시간 이내에 분리되고 확인된 콜로니가 생성됩니다. 이 프로토콜은 게놈 염기서열 분석과 같은 DNA 기반 방법과 호환되어 항균 내성 프로필, 독성 예측 및 계통발생 관계를 포함하여 캄필로박터 균주의 포괄적인 특성 분석을 제공합니다. 이 프로토콜은 생 가금류에서 Campylobacter spp.의 효율적인 회수 및 격리를 위한 유망한 대안을 제시하며, 이는 역학 연구 및 공중 보건 개입을 촉진할 수 있습니다.
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
이 연구는 미국 농무부 농업 연구 서비스(USDA-ARS), 국가 프로그램 108, 현재 연구 정보 시스템 번호 8072-42000-093 및 8072-42000-094-000-D의 지원을 받았습니다. 이 문서에서 상표명 또는 상업용 제품에 대한 언급은 특정 정보를 제공하기 위한 목적으로만 사용되며 미국 농무부의 권장 또는 보증을 의미하지 않습니다. USDA는 기회 균등 제공자이자 고용주입니다.
Materials
| Agar – Solidifying Agent (Difco) | Becton, Dickinson and Company (BD) | 281230 | |
| Analytical Balance | Mettler Toledo | JL602-G/L | Equipment |
| Analytical Balance | Mettler Toledo | AB54-S | Equipment |
| Antibiotic supplements cefoperazone, cycloheximide, trimethoprim, vancomycin | Oxoid Ltd. | SR0183E | |
| Atmosphere Control Gas Pak (Campy, 85% N2, 10% CO2, and 5% O2) | Becton, Dickinson and Company (BD) | 260680 | |
| Atmosphere Control Vessel, GasPak EZ CampyPak container system | Becton, Dickinson and Company (BD) | 260678 | |
| Autoclave – Amsco Lab250, Laboratory Steam Sterilizer | Steris plc | LV-250 | Equipment |
| Biological Safety Cabinet, Type A2, Purifier Logic+ | Labconco Corporation | 302411101 | Equipment |
| Bolton broth | Oxoid Ltd. | CM0983 | |
| Brucella broth (Difco) | Becton, Dickinson and Company (BD) | 211088 | |
| Buffered Peptone Water | Bio-Rad Laboratories Inc. | 3564684 | |
| Centrifuge Microcentrifuge 5424 | Eppendorf | 5424 | Equipment |
| Centrifuge, Avanti J-25 | Beckman Coulter, Inc. | Equipment | |
| Chicken thighs, wings, drumsticks, livers | Local retailers | ||
| DNA Extraction – PreMan Ultra Sample Preparation Reagent | Thermo Fisher Scientific Inc. | 4318930 | |
| FAM probe for hipO (Sequence 5'-TTGCAACCTCACTAGCAAAATCC ACAGCT-3') |
Integrated DNA Technologies | ||
| Filter – 0.45 µm sterile cellulose acetate filter | Merck-Millipore LTD | DAWP04700 | |
| Filter – 0.65 µm sterile cellulose acetate filter | Merck-Millipore LTD | HAWG04700 | |
| forward primer for cdtA (Sequence 5'-TGTCAAACAAAAAACACCAAGCT T-3' ') |
Integrated DNA Technologies | ||
| forward primer for hipO (Sequence 5'-TCCAAAATCCTCACTTGCCATT-3') | Integrated DNA Technologies | ||
| forward primer for IAC (Sequence 5'-GGCGCGCCTAACACATCT-3') | Integrated DNA Technologies | ||
| HEX probe for cdtA (Sequence 5'-AAAATTTCCCGCCATACCACTTG TCCC-3') |
Integrated DNA Technologies | ||
| Incubator – Inova 4230 refrigerated incubator shaker | New Brunswick Scientific | 4230 | Equipment |
| Inoculating Loop – Combi Loop 10µL and 1µL | Fisher Scientific International, Inc | 22-363-602 | |
| Internal Amplification Control (IAC) DNA fragment (Sequence 5'-TGGAAGCAATGCCAAATGTGTAT GTGGTGGCATTGTCTTCTCCC GTTGTAACTATCCACTGAGATG TGTTAGGCGCGCC-3') |
Integrated DNA Technologies | ||
| Laked horse blood | Remel Inc. | R54072 | |
| Manual pipette Pipet-Lite LTS Pipette L-1000XLS+ | Mettler Toledo | 17014382 | Equipment |
| Manual pipette Pipet-Lite LTS Pipette L-100XLS+ | Mettler Toledo | 17014384 | Equipment |
| Manual pipette Pipet-Lite LTS Pipette L-10XLS+ | Mettler Toledo | 17014388 | Equipment |
| Manual pipette Pipet-Lite LTS Pipette L-200XLS+ | Mettler Toledo | 17014391 | Equipment |
| Manual pipette Pipet-Lite LTS Pipette L-20XLS+ | Mettler Toledo | 17014392 | Equipment |
| Manual pipette Pipet-Lite Multi Pipette L8-200XLS+ | Mettler Toledo | 17013805 | Equipment |
| Manual pipette Pipet-Lite Multi Pipette L8-20XLS+ | Mettler Toledo | 17013803 | Equipment |
| Media Storage Bottle -PYREX 1 L Square Glass Bottle, with GL45 Screw Cap | Corning Inc. | 1396-1L | Equipment |
| Media Storage Bottle -PYREX 2 L Round Wide Mouth Bottle, with GLS80 Screw Cap | Corning Inc. | 1397-2L | Equipment |
| Microtiter plate, 96 well plate, flat bottom, polystyrene, 0.34 cm2, sterile, 108/cs | MilliporeSigma | Z707902 | |
| Mixer – Vortex Genie 2 | Scientific Industries Inc. | SI-0236 | Equipment |
| Motorized pipette controller, PIPETBOY2 | INTEGRA Biosciences Corp. | Equipment | |
| PCR Mastermix 2× TaqMan Gene Expression | Thermo Fisher Scientific Inc. | 4369542 | |
| Petri Dish Rotator - bioWORLD Inoculation Turntable | Fisher Scientific International, Inc | 3489E20 | Equipment |
| Petri Dishes with Clear Lid (100 mm x 15mm) | Fisher Scientific International, Inc | FB0875713 | |
| Pipette Tips GP LTS 1000µL S 768A/8 | Mettler Toledo | 30389273 | |
| Pipette Tips GP LTS 20µL 960A/10 | Mettler Toledo | 30389270 | |
| Pipette Tips GP LTS 200µL F 960A/10 | Mettler Toledo | 30389276 | |
| Reagent Reservoir, 25 mL sterile reservoir used with multichannel pipettors | Thermo Fisher Scientific Inc. | 8093-11 | |
| Realtime PCR – 7500 Real-Time PCR system | (Applied Biosystems, Foster City, CA) | Equipment | |
| reverse primer for cdtA (Sequence 5'-CCTTTGACGGCATTATCTCCTT-3') | Integrated DNA Technologies | ||
| reverse primer for hipO (Sequence 5'-TGCACCAGTGACTATGAATAACG A-3') |
Integrated DNA Technologies | ||
| reverse primer for IAC (Sequence 5'-TGGAAGCAATGCCAAATGTGTA -3') |
Integrated DNA Technologies | ||
| Serological Pipettes, Nunc Serological Pipettes (10 mL) | Thermo Fisher Scientific Inc. | 170356N | |
| Serological Pipettes, Nunc Serological Pipettes (2 mL) | Thermo Fisher Scientific Inc. | 170372N | |
| Serological Pipettes, Nunc Serological Pipettes (25 mL) | Thermo Fisher Scientific Inc. | 170357N | |
| Serological Pipettes, Nunc Serological Pipettes (50 mL) | Thermo Fisher Scientific Inc. | 170376N | |
| Spreader – Fisherbrand L-Shaped Cell Spreaders | Fisher Scientific International, Inc | 14-665-230 | |
| Stomacher bag, Nasco Whirl-Pak Write-On Homogenizer Blender Filter Bags | Thermo Fisher Scientific Inc. | 01-812 | |
| TAMRA probe for IAC (Sequence 5'-TTACAACGGGAGAAGACAATGCC ACCA-3') |
Integrated DNA Technologies | ||
| Thermocycler (GeneAmp PCR system 9700) | Applied Biosystems | Equipment | |
| Water Filtration – Elga Veolia Purelab Flex | Elga LabWater | PF2XXXXM1-US | Equipment |
References
- Rushton, S. P., et al. Climate, human or environment: Individual-based modelling of Campylobacter seasonality and strategies to reduce disease burden. J Transl Med. 17 (1), 34 (2019).
- Facciolà, A., et al. Campylobacter: From microbiology to prevention. J Prev Med Hyg. 58 (2), E79-E92 (2017).
- Perez-Arnedo, I., Gonzalez-Fandos, E. Prevalence of Campylobacter spp. In poultry in three spanish farms, a slaughterhouse and a further processing plant. Foods. 8 (3), 111 (2019).
- Nachamkin, I., Allos, B. M., Ho, T. Campylobacter species and guillain-barré syndrome. Clin Microbiol Rev. 11 (3), 555-567 (1998).
- Department of Food Administration. Bacteriological analytical manual. Department of Food Administration. , (1992).
- USDA Office of Public Health Science. Isolating and identifying Campylobacter jejuni/coli/lari from poultry rinsate, sponge and raw product samples. Microbiology Laboratory Guidebook. , (2022).
- Singh, H., Rathore, R. S., Singh, S., Cheema, P. S. Comparative analysis of cultural isolation and PCR based assay for detection of Campylobacter jejuni in food and faecal samples. Braz J Microbiol. 42 (1), 181-186 (2011).
- Kralik, P., Ricchi, M. A basic guide to real time pcr in microbial diagnostics: Definitions, parameters, and everything. Front Microbiol. 8, (2017).
- Linton, D., Lawson, A. J., Owen, R. J., Stanley, J. PCR detection, identification to species level, and fingerprinting of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli direct from diarrheic samples. J Clin Microbiol. 35 (10), 2568-2572 (1997).
- Kabiraz, M. P., Majumdar, P. R., Mahmud, M. M. C., Bhowmik, S., Ali, A. Conventional and advanced detection techniques of foodborne pathogens: A comprehensive review. Heliyon. 9 (4), e15482 (2023).
- Kaakoush, N. O., Castaño-Rodríguez, N., Mitchell, H. M., Man, S. M. Global epidemiology of Campylobacter infection. Clin Microbiol Rev. 28 (3), 687-720 (2015).
- Gilbreath, J. J., Cody, W. L., Merrell, D. S., Hendrixson, D. R. Change is good: Variations in common biological mechanisms in the epsilonproteobacterial genera Campylobacter and Helicobacter. Microbiol Mol Biol Rev. 75 (1), 84-132 (2011).
- Lertsethtakarn, P., Ottemann, K. M., Hendrixson, D. R. Motility and chemotaxis in campylobacter and helicobacter. Annu Rev Microbiol. 65, 389-410 (2011).
- Jokinen, C. C., et al. An enhanced technique combining pre-enrichment and passive filtration increases the isolation efficiency of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli from water and animal fecal samples. J Microbiol Methods. 91 (3), 506-513 (2012).
- Engberg, J., On, S. L., Harrington, C. S., Gerner-Smidt, P. Prevalence of Campylobacter, Arcobacter, Helicobacter, and Sutterella spp. In human fecal samples as estimated by a reevaluation of isolation methods for Campylobacters. J Clin Microbiol. 38 (1), 286-291 (2000).
- Lastovica, A. J., Le Roux, E. Efficient isolation of campylobacteria from stools. J Clin Microbiol. 38 (7), 2798-2799 (2000).
- USDA. Salmonella and Campylobacter verification program for raw poultry products. FSIS Directive 10250.1. 10000 Series: Laboratory Services. USDA. , (2021).
- He, Y., et al. Simultaneous detection and differentiation of Campylobacter jejuni, c. Coli, and c. Lari in chickens using a multiplex real-time PCR assay. Food Anal Methods. 3, 321-329 (2010).
- Suo, B., He, Y., Tu, S. -. I., Shi, X. A multiplex real-time polymerase chain reaction for simultaneous detection of salmonella spp., escherichia coli o157, and listeria monocytogenes in meat products. Foodborne Pathog Dis. 7 (6), 619-628 (2010).
- Chen, C. Y., Nace, G. W., Irwin, P. L. A 6 x 6 drop plate method for simultaneous colony counting and MPN enumeration of Campylobacter jejuni, listeria monocytogenes, and escherichia coli. J Microbiol Methods. 55 (2), 475-479 (2003).
- Speegle, L., Miller, M. E., Backert, S., Oyarzabal, O. A. Use of cellulose filters to isolate Campylobacter spp. From naturally contaminated retail broiler meat. J Food Prot. 72 (12), 2592-2596 (2009).
- Guirin, G. F., Brusa, V., Adriani, C. D., Leotta, G. A. Prevalence of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli from broilers at conventional and kosher abattoirs and retail stores. Rev Argent Microbiol. 52 (3), 217-220 (2020).
- Noormohamed, A., Fakhr, M. K. A higher prevalence rate of Campylobacter in retail beef livers compared to other beef and pork meat cuts. Int J Environ Res Public Health. 10 (5), 2058-2068 (2013).
- Walker, L. J., et al. Prevalence of Campylobacter coli and Campylobacter jejuni in retail chicken, beef, lamb, and pork products in three Australian states. J Food Prot. 82 (12), 2126-2134 (2019).
- Zhao, C., et al. Prevalence of Campylobacter spp., Escherichia coli, and Salmonella serovars in retail chicken, turkey, pork, and beef from the greater Washington, D.C., area. Appl Environ Microbiol. 67 (12), 5431-5436 (2001).
- Honsheng, H., Manuel Mariano, G., Guillermo, T. -. I., Saeed, E. -. A. . Campylobacter. , (2022).
- He, Y., et al. Rapid identification and classification of Campylobacter spp. using laser optical scattering technology. Food Microbiol. 47, 28-35 (2015).
- Steele, T. W., Mcdermott, S. N. The use of membrane filters applied directly to the surface of agar plates for the isolation of Campylobacter jejuni from feces. Pathology. 16 (3), 263-265 (1984).
- Bourke, B., Chan, V. L., Sherman, P. Campylobacter upsaliensis: Waiting in the wings. Clin Microbiol Rev. 11 (3), 440-449 (1998).
- Berrang, M. E., Meinersmann, R. J., Cox, N. A. Passage of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli subtypes through 0.45- and 0.65-micrometer-pore-size nitrocellulose filters. J Food Prot. 80 (12), 2029-2032 (2017).
- Hill, G. N., et al. Optimizing enrichment of Campylobacter on poultry. J App Poult Res. 26 (3), 307-315 (2017).
- Kim, J. C., Oh, E., Kim, J., Jeon, B. Regulation of oxidative stress resistance in Campylobacter jejuni, a microaerophilic foodborne pathogen. Front Microbiol. 6, 751 (2015).
- Nennig, M., et al. Metaphenotypes associated with recurrent genomic lineages of Campylobacter jejuni responsible for human infections in luxembourg. Front Microbiol. 13, (2022).
- Moore, J. E. Bacterial dormancy in Campylobacter: Abstract theory or cause for concern. Int J Food Sci Technol. 36 (6), 593-600 (2001).
- Saha, S., Saha, S., Sanyal, S. Recovery of injured Campylobacter jejuni cells after animal passage. Appl Environ Microbiol. 57 (11), 3388-3389 (1991).
- Baylis, C. L., Macphee, S., Martin, K. W., Humphrey, T. J., Betts, R. P. Comparison of three enrichment media for the isolation of Campylobacter spp. From foods. J Appl Microbiol. 89 (5), 884-891 (2000).
- Line, J. E. Development of a selective differential agar for isolation and enumeration of Campylobacter spp. J Food Prot. 64 (11), 1711-1715 (2001).
- Armstrong, C. M., et al. Impacts of clarification techniques on sample constituents and pathogen retention. Foods. 8 (12), 636 (2019).
