تصف هذه الورقة خوارزمية ارتباط الصور الرقمية مفتوحة المصدر لقياس سلالات الأنسجة 2D المحلية داخل نباتات الأوتار. تم التحقق من دقة التقنية باستخدام تقنيات متعددة ، وهي متاحة للاستخدام العام.
هناك اهتمام علمي كبير بفهم السلالات التي تواجهها خلايا الأوتار في الموقع وكيف تؤثر هذه السلالات على إعادة تشكيل الأنسجة. بناء على هذا الاهتمام ، تم تطوير العديد من التقنيات التحليلية لقياس سلالات الأنسجة المحلية داخل نباتات الأوتار أثناء التحميل. ومع ذلك ، في العديد من الحالات ، لم يتم الإبلاغ عن دقة وحساسية هذه التقنيات ، ولا تتوفر أي من الخوارزميات للجمهور. وقد جعل هذا من الصعب قياس سلالات الأنسجة المحلية على نطاق واسع في زراعة الأوتار. لذلك ، كان الهدف من هذه الورقة هو إنشاء أداة تحليل تم التحقق من صحتها لقياس سلالات الأنسجة المحلية في نباتات الأوتار المتاحة بسهولة وسهلة الاستخدام. على وجه التحديد ، تم تكييف خوارزمية ارتباط الصور الرقمية المعززة (ALDIC) المتاحة للجمهور لقياس سلالات 2D من خلال تتبع إزاحة نوى الخلية داخل أوتار أخيل الفأر تحت التوتر أحادي المحور. بالإضافة إلى ذلك ، تم التحقق من دقة السلالات المحسوبة من خلال تحليل الصور المحولة رقميا ، وكذلك من خلال مقارنة السلالات بالقيم المحددة من تقنية مستقلة (أي الخطوط المبيضة ضوئيا). أخيرا ، تم دمج تقنية في الخوارزمية لإعادة بناء الصورة المرجعية باستخدام حقل الإزاحة المحسوب ، والذي يمكن استخدامه لتقييم دقة الخوارزمية في حالة عدم وجود قيم إجهاد معروفة أو تقنية قياس ثانوية. الخوارزمية قادرة على قياس سلالات تصل إلى 0.1 بدقة 0.00015. نجحت تقنية مقارنة صورة مرجعية أعيد بناؤها مع الصورة المرجعية الفعلية في تحديد العينات التي تحتوي على بيانات خاطئة وأشارت إلى أنه في العينات ذات البيانات الجيدة ، كان ما يقرب من 85٪ من مجال الإزاحة دقيقا. أخيرا ، كانت السلالات المقاسة في أوتار أخيل الفأر متسقة مع الأدبيات السابقة. لذلك ، تعد هذه الخوارزمية أداة مفيدة للغاية وقابلة للتكيف لقياس سلالات الأنسجة المحلية في الأوتار بدقة.
الأوتار هي أنسجة حساسة ميكانيكيا تتكيف وتتدهور استجابة للتحميل الميكانيكي1،2،3،4. نظرا للدور الذي تلعبه المحفزات الميكانيكية في بيولوجيا خلايا الأوتار ، هناك اهتمام كبير بفهم السلالات التي تواجهها خلايا الأوتار في بيئة الأنسجة الأصلية أثناء التحميل. تم تطوير العديد من التقنيات التجريبية والتحليلية لقياس سلالات الأنسجة المحلية في الأوتار. وتشمل هذه تحليلات ارتباط الصورة الرقمية 2D / 3D (DIC) للإجهادات السطحية باستخدام أنماط البقع أو الخطوط المبيضة ضوئيا (PBLs) 5،6،7،8 ، وقياس التغيرات في المسافة من النقط الوسطى إلى النوى الفردية داخل الأنسجة9،10 ، وطريقة حديثة ثلاثية الأبعاد ثلاثية الأبعاد كاملة المجال تأخذ في الاعتبار الحركة خارج المستوى والتشوهات ثلاثية الأبعاد11 . ومع ذلك، لم يتم الإبلاغ عن دقة وحساسية هذه التقنيات إلا في حالات قليلة، ولم يتم إتاحة أي من هذه التقنيات للجمهور، مما يجعل اعتماد هذه التقنيات واستخدامها على نطاق واسع أمرا صعبا.
كان الهدف من هذا العمل هو إنشاء أداة تحليل تم التحقق من صحتها لقياس سلالات الأنسجة المحلية في نباتات الأوتار المتاحة بسهولة وسهلة الاستخدام. تعتمد الطريقة المختارة على خوارزمية ارتباط الصور الرقمية المعززة (ALDIC) المتاحة للجمهور والمكتوبة في MATLAB والتي تم تطويرها بواسطة Yang و Bhattacharya12. تم تكييف هذه الخوارزمية لتحليل عينات الأوتار والتحقق من صحتها من خلال تطبيقها على الصور المحولة رقميا ومقارنة السلالات المقاسة في عينات الأوتار الفعلية بالنتائج التي تم الحصول عليها من الخطوط المبيضة ضوئيا. علاوة على ذلك ، تم تنفيذ وظائف إضافية في الخوارزمية لتأكيد دقة حقل الإزاحة المحسوب حتى في حالة عدم وجود قيم إجهاد معروفة أو تقنية قياس ثانوية. لذلك ، هذه الخوارزمية هي أداة مفيدة للغاية وقابلة للتكيف لقياس سلالات الأنسجة 2D المحلية بدقة في الأوتار.
كان الهدف من هذه الورقة هو توفير طريقة مفتوحة المصدر ومعتمدة لقياس حقول إجهاد 2D في الأوتار تحت حمل الشد. استند أساس البرنامج إلى خوارزمية ALDIC المتاحة للجمهور12. تم تضمين هذه الخوارزمية في رمز MATLAB أكبر مع الوظيفة المضافة لتحليل الإجهاد التدريجي (مقابل التراكمي). ثم تم تطبيق هذه ا…
The authors have nothing to disclose.
تم تمويل هذا العمل من قبل المعاهد الوطنية للصحة (R21 AR079095) والمؤسسة الوطنية للعلوم (2142627).
5-DTAF (5-(4,6-Dichlorotriazinyl) Aminofluorescein), single isomer | ThermoFisher | D16 | |
Calipers | Mitutoyo | 500-196-30 | |
Confocal Microscope | Nikon | A1R HD | |
Corning LSE Vortex Mixer | Coning | 6775 | |
DRAQ5 Fluorescent Probe Solution (5 mM) | ThermoFisher | 62554 | |
MATLAB | MathWorks | R2022b | |
Tensile Loading Device | N/A | N/A | Tensile loading device described in Peterson et al, 2020. (ref 13) |
Tube Revolver Rotator | ThermoFisher | 88881001 |