本プロトコールは、ヒト人工多能性幹細胞由来2型肺胞上皮様細胞(iAT2s)を記載する。これらの細胞は、3D培養において自己再生スフェアとして培養することも、気液界面(ALI)培養に適合させることもできる。
肺では、肺胞上皮は環境刺激からの物理的な障壁であり、恒常性および疾患において不可欠な役割を果たす。2型肺胞上皮細胞(AT2s)は、遠位肺上皮の通性前駆細胞である。AT2の機能不全および傷害は、様々な肺疾患に起因し、寄与し得る。したがって、AT2生物学の理解の向上は、肺生物学および疾患を理解するために重要である。しかし、主要なヒトAT2は一般に分離が難しく、供給が限られている。これらの制限を克服するために、ヒト人工多能性幹細胞(iPSC)由来の2型肺胞上皮細胞(iAT2s)を、in vivo肺発生を反復する指向性分化プロトコールを介して生成することができる。iAT2はフィーダーフリーの状態で成長し、トランスクリプトームプログラムをヒト成人原発性AT2と共有し、界面活性剤の生産、包装、分泌などのAT2の主要な機能を実行します。このプロトコルは、3次元(3D)培養におけるシリアル継代によって自己再生iAT2を維持する方法、またはiAT2を気液界面(ALI)培養に適合させる方法を詳述する。iAT2sの単一細胞懸濁液は、3D可溶化基底膜マトリックス(以下「マトリックス」という)中でプレーティング前に生成され、そこで単層上皮球に自己集合する。3D培養中のiAT2sは、2D ALI培養において継代または播種される単一細胞懸濁液に連続的に解離させることができる。ALI培養では、iAT2は頂端表面が空気にさらされた偏光単分子膜を形成し、このプラットフォームを環境暴露に容易に順応させます。したがって、このプロトコルは無尽蔵のiAT2の供給を生成し、SFTPCtdTomato発現によって示されるAT2プログラムを維持しながら、15継代にわたって入力セルあたり1 x 1030セル以上を生成します。得られた細胞は、遺伝子変異の研究、環境曝露のモデル化、または薬物のスクリーニングに適用できる再現性のある関連性の高いプラットフォームを表します。
肺では、気道および肺胞上皮細胞は、吸入エアロゾルおよびタバコの煙などの有害な刺激を介して伝達される病原体を含む、吸入環境曝露に最初に遭遇する。2型肺胞上皮細胞(AT2s)は、遠位肺上皮の通性前駆細胞であり、肺胞表面張力を緩和する界面活性剤を産生し、吸入曝露に対する自然免疫応答をマウントするため、肺恒常性を維持するのに不可欠である1,2。しかし、AT2機能障害は、肺損傷またはAT2において選択的に発現される遺伝子(SFTPC、SFTPBおよびABCA33、4、5)の変異に起因する可能性がある。これらの遺伝子変異を研究するための以前のアプローチは、マウスモデル6または不死化細胞株7に導入された操作された変異含有ベクターに依存していた。したがって、生理学的に関連する細胞型および生産的なin vitroシステムにおけるAT2sに対する遺伝的および環境的摂動の影響をモデル化できるプラットフォームは、AT2が健康および疾患において果たす役割をさらに理解するために必要である。
空気中曝露のモデリングに関して、初代気道上皮細胞の気液界面(ALI)培養は、タバコの煙8に対する重要な分子応答を明らかにし、気道感染9,10をモデル化するために首尾よく利用されている。疾患における感染または傷害の重要な部位である肺胞上皮のための同等のALI培養系は、気道上皮モデル系と比較してはるかに開発されていない。不死化細胞株は、肺胞上皮11、12の代理としてALIで培養されてきたが、これらの細胞株は、初代肺胞上皮細胞13とは転写学的に異なり、界面活性剤を分泌する能力やALI12でタイトジャンクションを形成する能力などの重要な細胞機構を欠いている。初代ヒトAT2は、線維芽細胞1,14の存在下で3Dスフェアで培養することができるが、外植肺からのアクセスが制限されていること、およびこれまでのほとんどの培養において細胞表現型を老化または喪失させる傾向など、制限を受ける。これらの特性は、一次AT2のインビトロ研究の広範な採用に対する障壁を提示するが、一次AT2の拡大のためのフィーダーフリー3D培養の最適化において最近の進歩がなされている15、16、17、18。
ヒト人工多能性幹細胞(iPSC)由来の2型肺胞上皮細胞(iAT2s)を生成するためのin vivo発生マイルストーンを再現するために、指向性分化プロトコルが開発されています19。iAT2sは、CHIR99021、KGF、デキサメタゾン、cAMP、および「CK+DCI」19と称される3-イソブチル-1-メチルキサンチン(IBMX)を含む規定培地中で、3D無血清培養において自己再生スフェアとして増殖し、線維芽細胞フィーダーの非存在下で、20、21>20継代で培養することができる。さらに、iAT2sはトランスクリプトームプログラムをヒト成人原発性AT2と共有し、層状体を形成し、界面活性剤19、21、22を産生およびパッケージ化する。このプロトコルは、細胞を単一細胞懸濁液に解離させることによるiAT2のシリアル継代を詳述する。この時点で、iAT2sは、3D培養においてさらに再播種および増殖され得るか、または2D ALI培養物23において播種され得る。これらの方法は、ホメオスタシスおよび疾患20,22におけるAT2sの内因性生物学を研究し、以前に示されたように、スケーラブルで生理学的に関連するプラットフォーム23,24における化合物または刺激の効果を調査するために使用することができる。
AT2は肺の恒常性を維持し、これらの重要な肺胞細胞の機能不全は、様々な肺疾患を引き起こし、その結果として生じる可能性がある。一次ヒトAT2へのアクセスと分離が困難なため、iAT2が生成されます。他の場所25 に記載された指向性分化法およびここに記載される拡大および細胞播種を適用することによって、任意の個体から生成されたiPSCを、堅牢に自己再生するiAT2に分化させることができ、したがって、基礎生物医学研究開発研究、疾患モデリング、細胞ベースの治療、または薬物スクリーニングを含む生物医学研究のための患者特異的細胞を提供する。本プロトコールは、iAT2を単一細胞懸濁液に解離させる方法を詳述し、次いで、これを3Dマトリゲル中で再播種して細胞増殖のための肺胞スフェアを生成するか、またはさらなる実験のために2D ALI培養において再播種することができる。
このプロトコルには、3D培養とALI培養の両方で継代と再めっきを成功させるためのいくつかの重要なステップがあります。過度のピペッティングは細胞の生存率を低下させる可能性があるため、機械的摩砕は最小限に抑える必要があります。さらに、3D および 2D ALI 培養の両方における iAT2 の播種密度は非常に重要です。3D培養では、一般に、400細胞/μLの3DマトリゲルがほとんどのiPSC株に最適です。しかし、100~500細胞/μLの密度の範囲が成功していることもあり、異なる細胞株では密度の最適化が必要になる場合があります。ALI培養の場合、細胞培養インサート上のiAT2sの播種密度を最適化することも、播種後48時間(すなわち、エアリフトの日)の細胞のコンフルエントな単層を達成するために不可欠である。一部の iAT2 ラインでは、インサートごとにより多くのセルが必要です。したがって、トラブルシューティングが必要な場合は、24 ウェル細胞培養インサート用に 160,000 ~ 300,000 セル/インサートの範囲をお勧めします。3D 培養は、播種密度を 3D マトリックスの 400 cells/μL に維持し、マトリックス液滴サイズをそれぞれ 25 μL および 20 μL に減らすことによって、24 ウェルプレートおよび 48 ウェルプレートにスケーリングすることもできます。ALI 培養は、各インサートに 30 μL のマトリックスをコーティングし、インサートあたり 30 μL で 80,000 個の細胞をプレーティングし、1 ウェルあたり 150 μL の側底培地を供給することにより、96 ウェル細胞培養インサートにスケールすることができます。シード密度、マトリックスおよびメディアボリュームは、他のプレート形式に合わせてスケーリングおよび最適化する必要があります。
このプロトコルの制限は、ALIプレーティングに使用される細胞がiAT2 ALIを形成するためにNKX2-1+およびSFTPC+19,20,21,23であるように十分に精製されなければならないことであり、ALI培養形成はラインごとに異なる可能性がある。さらに、このプロトコルは、AT2のみの培養物の拡大および生成を可能にし、単一の重要な肺胞細胞型に基づく還元主義モデルシステムを提供する。重要なことに、肺胞1型細胞などの他の関連する肺胞細胞型が、これらのプラットフォームから欠落していた。他のグループは、線維芽細胞の有無にかかわらず、初代ヒトAT2をスフェロイドまたは有機型培養物として培養することに成功している1、14、15、16、17;しかしながら、初代ヒトAT2は、ALI条件を有さない通常の2D培養で培養すると、主要な界面活性剤の発現を失う傾向がある26。さらに、最近の研究は、iAT2sが新鮮で未培養のヒト初代AT2sよりも高い増殖マーカーおよび低いAT2成熟マーカーを発現することを示した27。iAT2と新鮮な初代ヒトAT2sとの間のこれらの違いにもかかわらず、我々は、培養された初代AT2でさえ、新鮮で未培養の初代AT2s2s27とのトランスクリプトーム的差異を示すことを見出し、したがって、これらのin vitroモデルは、in vivo肺生物学をモデル化するための様々な長所と限界を有すると結論付けた。
iAT2プラットフォームは、患者由来のiPSCからの遺伝子変異の研究に適用することができる19,20。このシステムは、ハイスループットの薬物スクリーニングに対応するために大幅にスケールアップすることもできます。加えて、iAT2 ALIsは、ウイルス感染もしくは細菌感染、またはタバコ煙、電子タバコ蒸気、または他のエアロゾル23への曝露などの環境曝露に適している。要約すると、iAT2sの3Dおよび2D ALI培養の両方を生成するためのこのプロトコルは、疾患関連細胞型の長期培養を可能にし、多くのアプリケーションでこれらの細胞の使用を可能にする生理学的でスケーラブルなプラットフォームを提供する。
The authors have nothing to disclose.
ウィルソン研究所、コットン研究所、ホーキンス研究所のメンバーの有益な議論に心から感謝します。また、Greg Miller(CReM Laboratory Manager)とMarianne James(iPSCコアマネージャ)の貴重なサポートにも非常に感謝しています。ブライアン・ティルトンとBUMCフローサイトメトリーコアの細胞選別に関する技術支援に感謝します(NIH助成金#1S10OD021587-01A1の支援を受けています)。この研究は、RBWに授与されたオーストラリア国立保健医療研究評議会のCJ Martin Early Career Fellowshipによって支援されました。NIHはKMAにF30HL147426を付与します。肺線維症財団からIM Rosenzweig Junior Investigator Awardを、ボストン大学臨床・トランスレーショナルサイエンス研究所(1UL1TR001430)からKDAにIntegrated Pilot Grant Awardを授与。スイス国立科学財団(P2ELP3_191217)からABAへ。NIHは、U01HL148692、U01HL134745、U01HL134766およびR01HL095993をDNKに付与します。NIHは、AAWに授与されたU01TR001810、R01DK101510、およびR01DK117940を付与します。iPSCのメンテナンス、バンキング、および共有は、NIHグラントNO1 75N92020C00005によってサポートされています。図 1 は、Biorender.com を使用して作成されました。
3-Isobutyl-1-methylxanthine (IBMX) | Sigma | I5879 | For CKDCI |
12 Well Cell Culture Plate | Corning | 3513 | Plates for culturing |
1-Thioglycerol (MTG) | M6145 | Sigma | For CKDCI |
2D Matrigel (matrix) – Matrigel hESC-Qualified Matrix | Corning | 8774552 | To coat ALI Transwells |
3D Matrigel (matrix) – Growth Factor Reduced Matrigel | Corning | 356230 | To grow iAT2 spheres in |
8-bromoadenosine 30,50-cyclic monophosphate sodium salt (cAMP) | Sigma | B7880 | For CKDCI |
Ascorbic Acid | A4544 | Sigma | For CKDCI |
B27 w/out retinoic acid | Life Technologies | 12587-010 | For CKDCI |
Bovine Serum Albumin (BSA) (7.5%) | Thermo Fisher | 15260037 | For CKDCI |
Calcein blue | Life Technologies | C1429 | For live/dead discrimination in flow cytometry |
Calcein green | Life Technologies | C1430 | Optional visualisation of cells on cell culture insert |
Cell culture inserts – Costar 6.5 mm Clear Transwells with 0.4 µm pore size | Millipore-Sigma | CLS3470-48EA | ALI transwells |
CHIR99021 | Tocris | 4423 | For CKDCI |
Dexamethasone | Sigma | D4902 | For CKDCI |
Dispase (2 mg/mL) | Thermo Fisher | 354235 | To dissolve matrigel |
Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) | Thermo Fisher | 11995 | To make trypsin inactivation media (10% FBS in DMEM) |
Dulbecco's Modified Eagle Medium/Nutrient Mixture F-12 (DMEM/F12) | Thermo Fisher | A4192002 | To wash |
Dulbecco's phosphate buffered saline (PBS) | Thermo Fisher | 14190 | For flow cytometric analyses |
Fetal bovine serum (FBS) (Hyclone charaterized) | GE Healthcare Life Sciences | SH30071.03 | To make trypsin inactivation media (10% FBS in DMEM) |
Glutamax | Life Technologies | 35050-061 | For CKDCI |
Ham's F-12 Nutrient Mixture (F12) | Cellgro | 10-080-CV | For CKDCI |
Hemocytometer | Fisher | 02-671-6 | For cell counting |
Invivogen Primocin 1 G (50 mg/mL) | Fisher Scientific | NC9392943 | For CKDCI |
Iscove's Modified Dulbecco's Medium (IMDM) | Thermo Fisher | 12440053 | For CKDCI |
Millicell ERS-2 Voltohmeter | Millipore | MERS00002 | To measure trans-epithlial electrical resistance |
N2 supplement | Life Technologies | 17502-048 | For CKDCI |
Recombinant human KGF | R&D Systems | 251-KG-010 | For CKDCI |
Retinoic acid | Sigma | R2625 | For CKDCI |
Trypan blue | Thermo Fisher | 15250061 | For cell count during passaging |
Trypsin-EDTA (0.05%) | Gibco | 25-300-062 | To dissociate iAT2 spheres |
Y-27632 dihydrochloride | Tocris | 1254 | Add to cells after passaging |