Här presenteras ett protokoll för en kapillärelektroforesbaserad väte/deuteriumutbytesmetod (HDX) i kombination med masspektrometri uppifrån och ner. Detta tillvägagångssätt karakteriserar skillnaden i högre ordningsstrukturer mellan olika proteinarter, inklusive proteiner i olika tillstånd och olika proteoformer, genom att genomföra samtidig differentiell HDX och elektroforetisk separation.
Chaihu, L., Yao, X., Xu, X., Zhu, Z., Chen, D. D. Y., Wang, G. Capillary Electrophoresis-based Hydrogen/Deuterium Exchange for Conformational Characterization of Proteins with Top-down Mass Spectrometry. J. Vis. Exp. (172), e62672, doi:10.3791/62672 (2021).